豬流行性腹瀉病毒（PEDV）的 S 蛋白（Spike 蛋白，刺突蛋白）是病毒表面的重要糖蛋白，在病毒感染宿主細胞過程中起關鍵作用。以下從毒株類型、蛋白結構、分子量及蛋白標簽等方面進行詳細說明：

一、PEDV-S 蛋白的毒株類型及變異

PEDV 屬于冠狀病毒科，根據基因序列差異，主要分為GⅠ 型和GⅡ 型，其中 GⅡ 型又包含多個亞型（如 GⅡa、GⅡb、GⅡd 等）。不同毒株的 S 蛋白序列存在一定變異，尤其是高變區（如 S1 亞基的 N 端結構域），這是導致病毒抗原性差異和宿主嗜性改變的重要原因。

• 經典毒株：如 CV777（GⅠ 型）、DR13（GⅡa 型），S 蛋白序列相對保守，是早期疫苗研發的主要毒株。
• 變異毒株：如中國近年來流行的 AJ1102（GⅡd 型）、韓國的 SM98 等，S 蛋白的氨基酸突變（尤其是 S1 亞基）更為顯著，可能導致傳統疫苗保護效率下降。

二、S 蛋白的結構與分子量

1. 蛋白結構

   • PEDV-S 蛋白是由病毒基因組 ORF1a 和 ORF1b 下游的 S 基因編碼的 Ⅰ 型跨膜糖蛋白，由約 1383-1442 個氨基酸組成，分為S1 亞基和S2 亞基： 
     • S1 亞基（N 端）：約氨基酸殘基 1-789，負責識別和結合宿主細胞表面受體（如氨肽酶 N，APN），包含多個抗原表位和高變區，是中和抗體的主要靶點。
     • S2 亞基（C 端）：約氨基酸殘基 790-1442，包含跨膜結構域和胞內結構域，參與病毒與宿主細胞膜的融合過程，結構相對保守。
   • S 蛋白在病毒表面以三聚體形式存在，形成棒狀刺突結構，其空間構象對病毒感染性至關重要。

2. 分子量

   • 未經糖基化的 S 蛋白前體分子量約為 150-160 kDa，經宿主細胞內質網和高爾基體糖基化修飾后，成熟 S 蛋白的分子量可增加至180-220 kDa（糖基化程度因毒株和宿主細胞而異）。

三、S 蛋白的標簽（生物學功能相關 “標簽”）

此處的 “蛋白標簽” 可從功能結構域、抗原表位及研究中常用的標簽蛋白兩方面理解：

1. 功能結構域標簽（天然結構特征）

   • 受體結合域（RBD，Receptor-Binding Domain）：位于 S1 亞基，是識別宿主細胞 APN 受體的關鍵區域，不同毒株的 RBD 序列差異可影響病毒的宿主范圍和感染效率（如變異株可能通過 RBD 突變增強對豬腸上皮細胞的親和力）。
   • 融合肽（Fusion Peptide）：位于 S2 亞基 N 端，在病毒與宿主細胞膜融合時插入細胞膜，促進膜融合過程。
   • 七肽重復序列（HR1 和 HR2）：位于 S2 亞基，形成螺旋結構，通過構象變化介導膜融合。

2. 抗原表位標簽（免疫識別位點）

   • S 蛋白包含多個線性表位和構象表位，其中構象表位依賴于 S 蛋白的三維結構，是中和抗體的主要作用位點。例如： 
     • GⅠ 型毒株（如 CV777）的 S1 亞基中，氨基酸殘基 499-513、530-560 等區域構成主要中和表位；
     • GⅡ 型變異株的 S1 亞基高變區（如氨基酸殘基 300-400、500-600）突變可導致抗原性改變，使傳統疫苗誘導的抗體中和效率降低。

3. 研究中使用的標簽蛋白（人工添加標簽）

   • 在基因工程表達和研究中，為便于 S 蛋白的純化、檢測或定位，常人工添加以下標簽： 
     • His 標簽（組氨酸標簽）：如 6×His 標簽，通過鎳柱親和層析純化重組 S 蛋白，是實驗室常用方法。
     • Flag 標簽（DYKDDDDK）：用于 Western blot、免疫共沉淀等檢測，識別抗體商業化程度高。
     • GFP（綠色熒光蛋白）/mCherry 標簽：與 S 蛋白融合表達，用于細胞內定位或病毒感染過程的可視化研究。

四、S 蛋白的關鍵作用與研究意義

1. 病毒感染機制
   S 蛋白是 PEDV 感染宿主的 “鑰匙”，其 RBD 與 APN 受體的結合是病毒入侵的第一步，而 S2 亞基的膜融合功能則決定了病毒基因組進入宿主細胞的效率。

2. 疫苗研發核心靶點

   • 由于 S 蛋白是主要的中和抗原，疫苗研發（如滅活疫苗、亞單位疫苗、活載體疫苗等）多以 S 蛋白為核心抗原，尤其是 S1 亞基的 RBD 和中和表位區域。
   • 針對變異毒株的 S 蛋白序列優化（如嵌合 S 蛋白疫苗）是當前研究熱點，以提高疫苗對流行毒株的交叉保護力。

3. 診斷與抗體檢測

   • 利用重組 S 蛋白（如 S1 亞基）作為包被抗原，可建立 ELISA 等方法檢測血清中的中和抗體，評估豬群免疫狀態或感染情況。

PEDV-S 蛋白作為病毒表面的關鍵糖蛋白，其結構變異（尤其是 S1 亞基）與病毒的致病性、抗原性密切相關，而分子量（180-220 kDa）和功能結構域（RBD、融合肽等）是理解其生物學功能的基礎。在研究中，人工標簽（如 His、Flag）的應用有助于 S 蛋白的表達和分析，而天然抗原表位的研究則為疫苗和診斷試劑開發提供了靶點。未來，針對 S 蛋白的結構生物學、變異規律及免疫保護機制的深入研究，將為 PED 的精準防控提供關鍵技術支持。