編者按

肝臟和腸道通過(guò)門靜脈（PV）直接相連，門靜脈是將腸道吸收的營(yíng)養(yǎng)物直接輸送到肝臟的血管。在正常情況下，肝臟的免疫系統(tǒng)能夠抵御入侵的腸道細(xì)菌和相關(guān)物質(zhì)，但目前對(duì)于肝臟免疫系統(tǒng)抵御炎癥的確切機(jī)制尚不清楚。本研究通過(guò)肝臟活體成像、單細(xì)胞測(cè)序及空間轉(zhuǎn)錄組等技術(shù)，在保留組織定位信息的同時(shí)，揭示了肝臟入口（即PV）附近的某些常駐巨噬細(xì)胞，表達(dá)高水平的白細(xì)胞介素-10和 Marco（巨噬細(xì)胞表面一種清道劑受體，可隔離促炎癥性病原體相關(guān)分子模式和損傷相關(guān)分子模式），從而抑制免疫反應(yīng)，在抵御腸道細(xì)菌和相關(guān)物質(zhì)引起的肝臟炎癥方面的重要作用。本文將聚焦單細(xì)胞及空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，重點(diǎn)介紹兩種技術(shù)在鑒定調(diào)節(jié)肝臟炎癥中的關(guān)鍵細(xì)胞類型并確定其作用靶點(diǎn)中的應(yīng)用。

文章詳情 

文章題目：Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation
發(fā)表時(shí)間：2024.05
期刊名稱：Nature
影響因子：50.5 
實(shí)驗(yàn)平臺(tái)：10x 單細(xì)胞測(cè)序；10x Visium 空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)、雙光子成像
DOI：10.1038/s41586-024-07372-6.

技術(shù)應(yīng)用

首先研究者利用10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，通過(guò)不同區(qū)域特征性基因的表達(dá)確定了組織切片PV 和 CV區(qū)的分布，并分析相關(guān)區(qū)域基因表達(dá)特征及功能，結(jié)果發(fā)現(xiàn)相比于CV區(qū)，PV區(qū)免疫抑制更加顯著。進(jìn)一步通過(guò)雙光子成像技術(shù)，可視化PV和CV區(qū)的免疫反應(yīng)。結(jié)果也發(fā)現(xiàn)，門靜脈周圍的巨噬細(xì)胞抑制炎癥反應(yīng)，在PV區(qū)具有更強(qiáng)的抑制活性，驗(yàn)證了Visium 的結(jié)果。

Fig.1  PV區(qū)分布的巨噬細(xì)胞亞群抑制免疫激活

為了進(jìn)一步鑒定位于CV及PV區(qū)的免疫抑制巨噬細(xì)胞亞群類型，研究者分別收集了CV和PV區(qū)的免疫細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序。結(jié)果鑒定了肝臟中不同類型的免疫細(xì)胞類型，基于空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果，研究者重點(diǎn)關(guān)注巨噬細(xì)胞亞群。將Kupffer進(jìn)一步分為兩個(gè)亞群：MP1和MP2（特異性表達(dá)Marco）。Kupffer細(xì)胞差異基因分析顯示，在MP2細(xì)胞中，編碼白細(xì)胞介素-10（IL-10）的基因（發(fā)揮抗炎作用）明顯增加，表明該MP2巨噬細(xì)胞亞群具有免疫抑制特性。

Fig.2  PV區(qū)MP2巨噬細(xì)胞亞群具有免疫抑制特性