醫(yī)生是一個又要看病，做手術(shù)又要熬夜看文獻寫標書的苦逼職業(yè)。Dr.S深感同情，為了幫助將有限的精力主要放在臨床上的廣大醫(yī)生同志們能更好的做科研，Dr.S將會陸續(xù)的為大家分享一系列近年發(fā)表的高分SCI文章，解析其中的思路和套路，看一下優(yōu)秀的臨床科研是怎么做的，今天先從國內(nèi)發(fā)病量第一的肺癌說起。

今天分享的這篇文章是2017年剛發(fā)表的一篇Journal of the National Cancer Institute文章，題目是Association of Uba6-Specific-E2 (USE1) With Lung Tumorigenesis好簡單粗暴，真可謂藝高人膽大，因為沒有完整的故事和大量的數(shù)據(jù)是會被審稿人抓小辮子的喲。所以建議各位看官在自己文章寫作的時候還是盡量按照“A基因通過B信號通路在C疾病中發(fā)揮D功能”的模式來，比較具體，不會被審稿人說題目太寬泛。

首先作者不知道從哪里找了一個基因USE1（Dr.S小貼士：一般這類新功能基因都是是樣本出發(fā)高通量篩選出來的或者通過數(shù)據(jù)庫挖掘出來的），發(fā)現(xiàn)這個基因的蛋白表達水平在肺癌組織中相對于正常組織顯著升高。而且它還有幾種突變型蛋白，也是癌組織里顯著升高的。但是mRNA水平卻變化不大，說明可能有轉(zhuǎn)錄后調(diào)控參與。

既然這個基因在肺癌里有臨床相關(guān)性，那這個基因有沒有功能呢？

把它干擾后細胞的體外增殖和轉(zhuǎn)移能力下降，且體內(nèi)成瘤能力也下降了。

再把它給過表達后發(fā)現(xiàn)結(jié)果完全逆轉(zhuǎn)了，充分說明這個基因在體內(nèi)外水平都是一個原癌基因。（Dr.S小貼士：其實干擾和過表達都能得到陽性結(jié)果還是比較困難的，可能需要多次重復(fù)實驗不斷摸索最佳條件，不過為了發(fā)表高分文章還是建議雙向驗證基因功能）

如果沒有追求的話做到這一步咱也能發(fā)文章了，但再咬牙努把力就能發(fā)10分的文章了，是不是心動了，那我們下面咋做呢？找互作蛋白啊！

通過質(zhì)譜我們發(fā)現(xiàn)了什么——CDC20和CDH1啊，明星基因有木有，而且CDC20和CDH1還能夠形成APC/C復(fù)合物來降解帶有D-box的蛋白，巧了，USE1就有D-box結(jié)構(gòu)域。

一個有趣的故事就這么出現(xiàn)了。如果細胞中USE1發(fā)生突變，D-box區(qū)域結(jié)構(gòu)改變，那么其不容易被APC/C降解，積累的USE1能夠引起細胞異常增殖和侵襲轉(zhuǎn)移，促使肺癌發(fā)生。

美中不足的是作者沒有解釋野生型USE1高表達引起肺癌細胞異常增殖和侵襲轉(zhuǎn)移的機制，可能要發(fā)另一篇文章吧。

Dr.S解讀：

1. 本文的最大創(chuàng)新點在于作者研究了一個從來沒在肺癌里研究過功能的編碼基因USE1，首次報道了其在肺癌中的臨床相關(guān)性和功能。

2. 有一個新功能基因在手發(fā)幾分的文章由你說了算，想發(fā)高分文章，臨床樣本數(shù)和下游機制探討少不了。

3. 做機制其實也有竅門，用高通量方法（芯片或者蛋白質(zhì)譜）篩選下游通路或者互作蛋白往往事半功倍。

4. 編碼基因研究的好處在于相對于非編碼基因，其功能往往更強，做功能實驗更容易出陽性結(jié)果，一般人我不告訴他。

根據(jù)吉凱基因的經(jīng)驗，從樣本出發(fā)芯片，測序，質(zhì)譜方法高通量篩選新功能基因的概率大約在10%左右，想要篩選驗證得到一個新功能基因的難度非常大。吉凱基因歷經(jīng)3年，斥資上億，已完成近6000個腫瘤相關(guān)基因的功能學(xué)篩選，從中找到明確的腫瘤功能標志基因若干，等待您來尋寶～～～

長按加關(guān)注