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ArrayJet生物芯片點(diǎn)樣儀助力慢性淋巴細(xì)胞白血病的蛋白標(biāo)志物篩選

瀏覽次數(shù):400 發(fā)布日期:2025-6-12  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
慢性B淋巴細(xì)胞白血病(B-CLL)是最常見(jiàn)的血液癌癥,具有高度的基因組異質(zhì)性,目前研究多集中在基因組和轉(zhuǎn)錄組水平,對(duì)蛋白質(zhì)組,尤其是蛋白磷酸化修飾的功能及影響了解甚微。蛋白磷酸化是調(diào)控細(xì)胞信號(hào)的翻譯后關(guān)鍵修飾,與 CLL 的信號(hào)通路密切相關(guān),如 B 細(xì)胞抗原受體(BCR)的 tonic 信號(hào)傳導(dǎo)(低水平持續(xù)激活)在 CLL 發(fā)展中起關(guān)鍵作用,涉及 LYN、SYK 等酪氨酸激酶。現(xiàn)有治療如 BTK 抑制劑(伊布替尼)和 BCL-2 抑制劑(維奈托克)雖有效,但存在耐藥性和自身微環(huán)境影響等問(wèn)題,且缺乏早期診斷和個(gè)性化治療的生物標(biāo)志物。整合蛋白質(zhì)芯片和質(zhì)譜等高通量篩選技術(shù)為分析蛋白質(zhì)組的磷酸化提供了可能。


 
文章題目為“Tonic signaling of the B-cell antigen-specific receptor is a common functional hallmark in chronic lymphocytic leukemia cell phosphoproteomes at early disease stages”于2025年3月發(fā)表在Molecular Oncology雜志,作者來(lái)自于西班牙薩拉曼卡大學(xué)腫瘤研究中心。

在本研究中,19 例CLL樣患者(18 例 B-CLL 和 1 例 CLL )為研究對(duì)象。首先采集外周血(PB),流式細(xì)胞儀純化 CD19?、CD5?的腫瘤 B 細(xì)胞,純度 > 98%,凍存于液氮中備用。隨后使用含尿素的裂解緩沖液(尿素、磷酸酶抑制劑等)裂解細(xì)胞,超聲處理后離心收集上清液,并測(cè)定蛋白濃度。通過(guò)磷酸酪氨酸抗體免疫親和法富集磷酸肽,使用質(zhì)譜儀分析總蛋白和磷酸化肽段。蛋白組分析檢測(cè)到 13,504 個(gè)獨(dú)特肽段,對(duì)應(yīng) 2,970 個(gè)蛋白質(zhì),其中 28 個(gè)為新發(fā)現(xiàn)蛋白;蛋白磷酸化分析鑒定到 594 個(gè)磷酸肽段,對(duì)應(yīng) 316 個(gè)磷酸化蛋白,包括 55 個(gè)新發(fā)現(xiàn)磷酸肽段。英國(guó)ArrayJet生物芯片點(diǎn)樣儀制備蛋白質(zhì)芯片,檢測(cè)磷酸化蛋白表達(dá)。將 208 種抗體(靶向 162 種蛋白)點(diǎn)印在氨基修飾的玻片上,隨后孵育生物素標(biāo)記的蛋白以及Cy5標(biāo)記的鏈霉親和素, 雜交后使用熒光芯片掃描儀進(jìn)行熒光信號(hào)分析。

圖1:實(shí)驗(yàn)流程,從蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析到親和蛋白質(zhì)組學(xué)(蛋白質(zhì)微陣列)和WB驗(yàn)證。B-CLL: b細(xì)胞慢性淋巴細(xì)胞白血病;CLL:慢性淋巴細(xì)胞白血病;ESI-HCD:高能碰撞解離的電噴霧電離;(ESI)LC-MS /MS:液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜;MBL:?jiǎn)慰寺細(xì)胞淋巴細(xì)胞增多癥;PTM:翻譯后修飾;WB,:western blot。

研究發(fā)現(xiàn)在2160個(gè)共表達(dá)蛋白中,有10%(220 個(gè))發(fā)生了磷酸化,其主要參與 B 細(xì)胞激活和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo);BCR的 tonic 信號(hào)傳導(dǎo)和 NF-κB/STAT3 通路是 CLL 和 MBL 磷酸化組的共同特征。55 個(gè)新磷酸肽的發(fā)現(xiàn)擴(kuò)展了 CLL 磷酸化組數(shù)據(jù)庫(kù),為機(jī)制研究提供了可能的潛在靶點(diǎn),并發(fā)現(xiàn)9 個(gè)磷酸化蛋白(如 BTK、SYK)與早期疾病階段高度相關(guān),可用于預(yù)后評(píng)估和治療監(jiān)測(cè)。整合多組學(xué)技術(shù)(質(zhì)譜、蛋白質(zhì)篩選芯片),提供了CLL蛋白質(zhì)組和磷酸化組的全景圖譜,為理解疾病異質(zhì)性、開(kāi)發(fā)新型生物標(biāo)志物奠定了基礎(chǔ)。

原文鏈接:https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/1878-0261.70032

Arrayjet位于英國(guó)愛(ài)丁堡,專注于提供生物芯片應(yīng)用領(lǐng)域的解決方案及服務(wù)。自2000年公司成立即致力于開(kāi)發(fā)新型生物樣品噴點(diǎn)方案–噴墨式液體處理平臺(tái),該系統(tǒng)于2006年上市,目前用戶遍布全球27個(gè)國(guó)家。

Mercury系列產(chǎn)品采用獨(dú)特的飛行噴墨點(diǎn)樣技術(shù)實(shí)現(xiàn)行業(yè)第一的快速、非接觸式微量液體處理。同時(shí)上萬(wàn)種不同樣品可以進(jìn)行快速點(diǎn)樣,專利的上樣模塊配合高通量的點(diǎn)樣噴頭保障您的點(diǎn)樣操作快速、無(wú)污染,更低的上樣體積可有效減少樣品損失,使您的珍貴樣品物盡其用。



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