應用案例一：Binaree組織透明化技術結合三維重建血管在研究低氧條件下腦血管重塑
The Role of PRRC2B in Cerebral Vascular Remodeling Under Acute Hypoxia in Mice
 

高原暴露可導致多種認知功能障礙。腦血管系統通過減少對大腦的氧和營養供應在缺氧誘導的認知缺陷中起著不可或缺的作用。RNA N6‐甲基腺苷(m6A)易受修飾并調節基因表達以應對環境變化，包括缺氧。采用Binaree組織透明化與共聚焦成像分析發現在內皮細胞中，條件敲除PRRC2B可促進缺氧誘導的血管重塑和腦血流再分布，從而減輕缺氧誘導的認知功能下降。因此，PRRC2B作為一種新型RNA結合蛋白在缺氧誘導的血管重構過程中發揮重要作用。這些發現為缺氧誘導的認知功能下降提供了新的潛在治療靶點。
 

研究亮點
組織透明化技術結合血管三維重建與高分辨率血管成像
Binaree技術結合三維重建，使得血管成像的分辨率大大提高，能夠清晰地展示低氧條件下血管的微細結構變化，如新生血管的形成、血管分支的變化等。

動態與定量分析低氧條件下的血管反應
使用透明化和三維重建技術，能夠動態觀察并記錄低氧環境下腦血管的重塑過程。這包括詳細追蹤低氧引起的血管生成、擴展、重塑和功能性改變，幫助理解這些過程的時間動態特征。

通過三維重建獲得的數據，可以進行精確的定量分析，評估血管長度、分支點數量、血管密度、直徑等參數的變化。這些量化數據有助于深入理解低氧條件對血管結構的具體影響。

驗證PRRC2B在內皮細胞中的關鍵作用
驗證了PRRC2B在內皮細胞遷移、血管生成和結構重塑中的關鍵作用。這些技術提供了直觀的證據，支持PRRC2B作為潛在治療靶點在低氧誘導認知障礙中的應用前景。

應用案例二：Binaree快速組織透明化結合大鼠MACO缺血模型

組織透明化MCAO模型大鼠腦內血管三維可視化流程

MCAO模型組織透明化大鼠腦內血管三維可視化血管重建

(A)凝集素染色的3mm厚大鼠腦切片血管三維重建圖。圖像由配備4倍物鏡的LSMS獲得。
(B)最大投影(z-stack)腦冠狀切片標記線三維圖像為正交視圖所見xz平面。
(C-F)為(A)框狀區域XY平面(成像體積為1000 μm ×1000 μm ×1000 μm)的高倍視圖。
(D, F)示蹤劑(C, E)示蹤劑模型。
(G, J)為(A)中框框區域的三維重構圖。
(H, I)顯示了(G, J)隨機深度的腦切片圖像(相對于頂部成像面Z= 640 um)。
(K)每片3 - 4個視場的長度和血管直徑量化(n=3)。
比例尺= 2mm in (A-B)， 100 μ in (G- f, H-I)， 300 μ in (G, J)。

MCAO后24小時組織透明化樣本gfap相關免疫熒光強度的三維可視化和定量分析

 

(A-B)大鼠0.5 mm厚的腦切片經凝集素(A)和GFAP(B)染色后的三維重建。(C-J)顯示(A和B)中框區域的高倍放大視圖。損傷側皮質血管密度較對側減少，gfap陽性熒光強度較對側增加。(E-F)損傷側皮質和紋狀體gfap陽性細胞的形態學變化。(G) GFAP比值圖。MCAo損傷后24 h同側與對側皮質相關熒光強度。梗死區gfap相關熒光強度明顯增加。數據以平均值表示:誤差條表示平均值的標準誤差。“pc0.05。比例尺A-B為1 mm, C-J為100 μm, K-N為50 μm。