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如何使用KeyPro污染凈化儀防止RNA的降解和保證PCR的結(jié)果準(zhǔn)確性

瀏覽次數(shù):2485 發(fā)布日期:2020-2-19  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

在此次的新型冠狀病毒疫情中,核酸檢測(cè)作為確診的金標(biāo)準(zhǔn)發(fā)揮著重要的作用。眾所周知,本次新冠病毒的核酸檢測(cè)流程為采樣(咽拭子、肺泡灌洗液),提取病毒RNA,再經(jīng)過(guò)RT-qPCR或者一步法RT-數(shù)字PCR檢測(cè)樣本。但近期關(guān)于核酸檢測(cè)準(zhǔn)確性的討論也甚囂塵上,其中PCR實(shí)驗(yàn)污染是導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)有偏差的原因之一, 造成PCR實(shí)驗(yàn)污染的主要原因有以下幾點(diǎn),樣本間交叉污染(樣本泄漏引起的交叉,樣本提取過(guò)程中移液器、耗材的污染),PCR試劑的污染(容器、耗材、移液器,水等被污染),PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染,氣溶膠污染,克隆質(zhì)粒污染等。

在病毒核酸檢測(cè)過(guò)程中,結(jié)果的準(zhǔn)確性除了檢測(cè)方式的靈敏度很重要以外,保證提取RNA樣本的完整性也十分重要。今天我們就聊聊如何防止RNA降解,獲得高質(zhì)量的RNA進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。導(dǎo)致RNA降解最主要的物質(zhì)就是RNase,RNase非常穩(wěn)定,且無(wú)處不在,用常規(guī)的高溫高壓蒸汽方法和蛋白酶抑制劑不能使所有的RNase完全失活。

RNase結(jié)構(gòu)

除上述方法外,研究人員最常用的就是使用DEPC等對(duì)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中使用的耗材和試劑進(jìn)行處理,但DEPC處理時(shí)間長(zhǎng)且有毒,下面給出遠(yuǎn)離DEPC的三大理由:

1、DEPC 對(duì)人體有害,DEPC為高活性烷化試劑,能對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行共價(jià)稀釋?zhuān)蛊浣M氨基團(tuán)的乙氧基甲酸化(RNase 活性位點(diǎn)有兩個(gè)組氨基酸,故能被滅活);同時(shí)能使 RNA 分子中沒(méi)配對(duì)的腺嘌呤羥甲基化,改變其活性,嚴(yán)重時(shí)會(huì)影響 RNA 形成雜交雙鏈的能力,歸為強(qiáng)致癌物,使用時(shí)要十分小心。

2、不能處理一些試劑:例如:一級(jí)胺的試劑TRIS,PBS等,會(huì)發(fā)生化學(xué)反應(yīng);二是不能高壓滅菌的試劑,DTT,dNTP,Mgcl2,因?yàn)?DEPC必須通過(guò)高壓滅菌去除;三是不能用于PH低于4及以下的試劑,DEPC在此條件下對(duì)RNase沒(méi)有滅活作用。

3、DEPC不適合某些實(shí)驗(yàn),測(cè)OD值的實(shí)驗(yàn),OD讀數(shù)跟 PH 有關(guān), DEPC 在溶液中分解后變成乙醇和二氧化碳,部分二氧化碳與水反應(yīng)形成碳酸,導(dǎo)致 PH 降低,進(jìn)而降低OD值。

 

實(shí)驗(yàn)者迫切需要一種非?焖偾曳奖愕娜コ齊Nase的方法,保證結(jié)果的準(zhǔn)確性。使用 KeyPro™KP100生物污染紫外凈化儀,通過(guò)275nm和365nm雙紫外的協(xié)同作用可在5min解除上述污染煩惱。免清洗,無(wú)化學(xué)殘留,方便快捷,適用于高保真 RNA 文庫(kù)制備,測(cè)序和 PCR 實(shí)驗(yàn)室中的微孔板去污、移液器、水、金屬、陶瓷、塑料、玻璃等表面RNase的滅活等。同時(shí)KeyPro™KP100還可以去除病毒和細(xì)菌等的污染,防止實(shí)驗(yàn)用品導(dǎo)致的實(shí)驗(yàn)結(jié)果和環(huán)境污染。

KeyPro™KP100 生物污染紫外凈化儀采用 SLM™專(zhuān)利技術(shù)將 LED 陣列,光學(xué)元件和熱冷卻技術(shù)集于一身,可最大限度地提高消毒和去污性能,為您節(jié)省寶貴的科研時(shí)間。

儀器優(yōu)勢(shì):

1. 5min 完全滅活污染物

2. 觸屏操作,簡(jiǎn)單易用

3. 快速,通量高

4. 穩(wěn)定,一致的效果

5. 降低實(shí)驗(yàn)室耗材成本

6. 工作流程集成化

發(fā)布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯(lián)系電話:0512--86860010
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