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naica️®微滴芯片數(shù)字PCR在探尋肝病石蠟樣本與新發(fā)現(xiàn)病毒關(guān)系的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):1719 發(fā)布日期:2021-11-8  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

維也納獸醫(yī)大學(xué)的研究者們進(jìn)行了一項(xiàng)回顧性研究,用以評估馬細(xì)小肝炎病毒EqPV-H在蒂勒氏病以外的組織病理學(xué)異常的馬和驢肝臟中是否存在及其相關(guān)性,研究者們希望通過該研究確認(rèn)新發(fā)現(xiàn)不久的EqPV-H是否會導(dǎo)致其他的肝臟疾病,并且通過EqPV-H的感染情況進(jìn)一步分析EqPV-H病毒的感染模式。

亮點(diǎn):

1.通過采用新技術(shù)的回顧性研究,對之前收集的樣本進(jìn)行分析,找到EqPV-H病毒可能與腫瘤性疾病存在關(guān)聯(lián)。

2. 憑借naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)的直接絕對定量和對抑制劑的高耐受性,快速、高效的進(jìn)行拷貝數(shù)的檢測,確定組織樣本中的病毒含量。

3.通過對不同部位病毒含量的檢測進(jìn)一步佐證了EqPV-H病毒的嗜肝性,以及其慢性感染的可能性。

馬細(xì)小肝炎病毒是什么?

蒂勒氏病是一種與馬相關(guān)的急性、爆發(fā)性肝壞死疾病,該疾病1918年在南非發(fā)現(xiàn),后續(xù)也不斷有馬出現(xiàn)該病,且主要與馬源性生物制品如馬血漿、破傷風(fēng)和肉毒中毒抗毒素的給藥有關(guān),因此推測該病應(yīng)該與一種傳染性的病原體相關(guān),但一直沒有找到該病原體。直到2018年,科學(xué)家在一匹接受破傷風(fēng)抗毒素后死于蒂勒病的馬的血清和肝臟樣本中檢測到一種未知病毒,新發(fā)現(xiàn)的病毒被命名為馬細(xì)小病毒肝炎EqPV-H。通過對最近的蒂勒氏病例檢測發(fā)現(xiàn),該病毒在染病馬匹中均存在。且該病毒具有嗜肝性,血清和肝中的病毒載量最高。其他方面的研究也支持了該病毒是蒂勒氏病的病原體的假說。

本文則主要通過對之前的標(biāo)本進(jìn)行分析,探尋EqPV-H作為一種新發(fā)現(xiàn)的病毒,其是否還有一些其他的病理作用,是否與其他肝臟疾病相關(guān)?

回顧性的EqPV-H檢測結(jié)果如何?

研究者們收集了各類因肝組織病理學(xué)異常的臨床樣本,將其分為7組,包括腫瘤疾病,炎癥性疾病、肝硬化、循環(huán)障礙、毒性和肝代謝疾病、多種疾病(1-5組中2種以上的病理學(xué)特征)和正常肝組織。在這些收集到的92例肝臟樣本中,只有2例發(fā)現(xiàn)了EqPV-H病毒,且兩例均診斷為腹部腫瘤。但癌癥與機(jī)會性感染的高易感性是相關(guān)的,因?yàn)槟[瘤性疾病伴隨的全身虛弱和免疫抑制可能促進(jìn)EqPV-H繼發(fā)感染,所以EqPV-H是否可能是馬科動物原發(fā)性肝腫瘤發(fā)生的誘因,需要進(jìn)一步的研究來評估。

通過對這兩例樣本的進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在這匹馬的脾臟組織(腫瘤轉(zhuǎn)移部位)以及心臟和肺組織中也可以檢測到非常低的EqPV-H。這與之前的研究相一致,肝臟中病毒載量最高,其他組織中含量較低但也可持續(xù)存在,這意味著該病毒可能存在慢性感染。

進(jìn)一步通過naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)對病毒的載量進(jìn)行絕對定量分析,EqPV-H核酸陽性的兩個(gè)肝臟樣本,病毒載量分別為5×103和9.5×103GE/百萬細(xì)胞,略低于其他研究中肝臟樣本1.26×104GE/百萬細(xì)胞到2.04×109GE/百萬細(xì)胞的病毒載量,這可能是慢性感染的另一個(gè)跡象。

▲ naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)檢測肝臟1號和2號樣本中EqPV-H和細(xì)胞校正基因TTC17絕對定量結(jié)果。

由于這項(xiàng)研究是回顧性的,所有的組織樣本在室溫下被石蠟包埋1至17年,這可能會影響可檢測病毒的數(shù)量。但仍然在其中2匹腫瘤性疾病的馬樣本中檢測到EqPV-H病毒,這表明EqPV-H感染和腫瘤性疾病之間可能存在關(guān)聯(lián)甚至相互作用。

盡管這篇文章最終并未得出某種疾病與EqPV-H的確切關(guān)系,但是通過naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)這樣的新技術(shù)和新發(fā)現(xiàn)的病毒EqPV-H對以前的樣本進(jìn)行回顧性研究,仍然發(fā)現(xiàn)了一些之前從未了解到的新內(nèi)容,也為其他的研究提供了新的思路和方向。

期刊《viruses》

Viruses (ISSN 1999-4915) 是一個(gè)國際性開放獲取期刊, 至今已被SCIE、PubMed 、Scopus等各類數(shù)據(jù)庫索引,其最新影響因子為3.465。作為病毒學(xué)研究的高級論壇,該期刊旨在幫助研究人員細(xì)致的展示他們的前沿發(fā)現(xiàn)和觀點(diǎn),并使其迅速傳播。

naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)

法國Stilla Technologies公司的naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)在進(jìn)行核酸檢測時(shí)具有獨(dú)特的優(yōu)勢。該系統(tǒng)利用cutting-edge微流體創(chuàng)新型芯片—Sapphire芯片(或高通量Opal芯片)作為數(shù)字PCR過程的耗材。樣品通過毛細(xì)通道網(wǎng)格以30,000個(gè)微滴的形式進(jìn)入2D芯片中。3色熒光檢測儀器,整個(gè)流程只需要2.5小時(shí),并可進(jìn)行數(shù)據(jù)的質(zhì)控和結(jié)果追溯分析,獲得的數(shù)據(jù)真實(shí)可靠。

naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)

法國Stilla Technologies公司naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),源于Crystal微滴芯片式數(shù)字PCR技術(shù),自動化微滴生成和擴(kuò)增,每個(gè)樣本孔可實(shí)現(xiàn)6熒光通道的檢測,智能化識別微滴并進(jìn)行質(zhì)控,3小時(shí)內(nèi)即可獲得至少6個(gè)靶標(biāo)基因的絕對拷貝數(shù)濃度。

發(fā)布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯(lián)系電話:0512--86860010
E-mail:info@aperbio.com

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