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如何在PCR檢測(cè)過(guò)程中降低檢測(cè)結(jié)果假陰性概率

瀏覽次數(shù):2681 發(fā)布日期:2020-5-5  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
  1. 什么是PCR技術(shù)?
PCR技術(shù)又稱為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。是一種用于放大擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的最大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加。
在新冠病毒檢測(cè)中,核酸檢測(cè)被定義為臨床診斷的金標(biāo)準(zhǔn),RT-PCR技術(shù)被反復(fù)提到,它是一種將RNA反轉(zhuǎn)錄與PCR相結(jié)合的技術(shù)。首先在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,將提取到的RNA合成cDNA,再以cDNA為模板,在DNA聚合酶作用下不斷擴(kuò)增(變性-退火-延伸多個(gè)循環(huán))合成目的片段并進(jìn)行分析。
 
  1. PCR用水
PCR技術(shù)目前多搭配試劑盒使用,也有用戶自行制備反應(yīng)體系,無(wú)論哪個(gè)過(guò)程都需要使用水。無(wú)論是近年來(lái)季節(jié)性爆發(fā)的甲流乙流,還是目前全球都在經(jīng)歷的新冠病毒,在檢測(cè)過(guò)程中都涉及一個(gè)痛點(diǎn),那就是如何盡可能提高核酸檢測(cè)的準(zhǔn)確性,減少假陰性結(jié)果出現(xiàn)的可能性。
我們首先分析一下假陰性結(jié)果出現(xiàn)的可能性,以新冠病毒核酸檢測(cè)為例,假陰性的主要原因有:
  • 病人病程:不同病程,患者體內(nèi)病毒載量不同
  • 采樣部位:咽拭子,鼻咽拭子,痰液,肺泡灌洗液等不同采樣部位病毒載量均不同
  • 采樣準(zhǔn)確性:拭子質(zhì)量,工作人員操作等
  • 試劑盒的質(zhì)量:引物設(shè)計(jì)以及水質(zhì)控制
為了順利將提取到的RNA反轉(zhuǎn)錄并實(shí)現(xiàn)DNA的成功擴(kuò)增,必須抑制核糖核酸酶(RNases)的降解作用,如果試劑盒用水內(nèi)含RNases,將極有可能導(dǎo)致假陰性結(jié)果的出現(xiàn)
 
  1. 去除RNases的主要方法
  • 高壓滅菌:即便是在180℃下高壓滅菌4h之后,RNases仍保持某些活性,且某些特定細(xì)菌失活會(huì)釋放更多的RNases
  • DEPC法(二乙基焦碳酸酯處理法):利用二乙基焦碳酸酯(DEPC)處理方法使化學(xué)酶失活是用來(lái)抑制水溶液中RNases活性的常見(jiàn)方法。然而,二乙基焦碳酸酯是一種可疑致癌物,處理須小心;同時(shí)該方法雖然能夠使酶永久失活,卻無(wú)法將其從水中去除,同時(shí)清除多余的DEPC過(guò)程中,會(huì)產(chǎn)生乙醇,二氧化碳等其他污染物。
  • 超濾法:超濾是一種真正能夠從水溶液中清除RNases的方法。默克Milli-Q選用內(nèi)置在丙烯腈丁苯橡膠(ABS)外殼中的聚砜超過(guò)濾膜作為超濾柱的主要成分,在一定水流速一定濃度范圍內(nèi),超濾具有充分的截留作用。超濾處理可有效取代DEPC處理方法生產(chǎn)無(wú)RNase水。
 
 
  1. Milli-Q生產(chǎn)無(wú)RNases水解決方案:
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發(fā)布者:默克生命科學(xué)
聯(lián)系電話:400-900-3055轉(zhuǎn)8
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標(biāo)簽: PCR Milli-Q RNases
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