通過Discovery Studio軟件預測了人/鼠PD-1交叉反應抗體的結合模式，并輔助以實驗驗證，從而精細解釋了具有人/鼠交叉反應抗體的交叉反應性機制，為后續PD-1抗體研發做出指導。
 

程序性死亡受體1（PD-1）是一種重要的免疫抑制受體分子，以PD-1為靶點的免疫調節在抗腫瘤、抗感染、抗自身免疫性疾病及器官移植存活等方面均有重要的意義。PD-1抗體是當前備受矚目，廣為關注的一類腫瘤療法。考慮到PD-1抗體在治療各種癌癥中的重要性和廣泛應用，文章作者希望開發同人/鼠PD-1有交叉反應的抗體以加速PD-1抗體的臨床前研究。目前批準用于臨床或正在研發中的PD-1抗體都只靶向人hPD-1，而并不顯示與鼠mPD-1有交叉反應。因此，本文開發并首次報道了一種具有人/鼠PD-1交叉反應的功能性抗體，并將該抗體的表位與僅同hPD-1結合的抗體表位進行了比較。

文章作者首先用hPD-1和mPD-1免疫大鼠，通過篩選大量的大鼠雜交瘤克隆發現了既能靶向hPD-1又能靶向mPD-1的抗體R9和只靶向hPD-1的抗體R11。為了快速識別兩個抗體的表位，本研究采用了丙氨酸掃描，并基于ELISA和表面等離子共振技術。同時結合分子模擬的方法，采用Discovery Studio（DS）中MODELER程序構建出了R11和R9抗體結構模型，并在此基礎上使用DS_ZDOCK/RDOCK蛋白-蛋白對接/優化程序，將這兩個抗體與hPD-1進行了對接，預測了兩種抗體不同的結合模式，研究了他們的結合表位，從而精細解釋了具有人/鼠交叉反應抗體的交叉反應性機制。