1.微生物-------生物產物的來源

不管過去、現在和將來，微生物是各種生物活性產物的豐富資源。生物活性物質很多，有微生物的初級代謝產物，如氨基酸、維生素等；有微生物的次級代謝產物，如抗生素等。要獲得所需生物特性的新產物，關鍵是：生物產物的來源-----微生物的選擇；采用什么樣的篩選方案（檢測系統）。過去的40多年里，重點放在篩選醫療用途的抗生素。

抗細菌治療方面：青霉素、頭孢菌素和四環類抗生素；抗癌、抗真菌感染方面：絲裂霉素、灰黃霉素等；其他治療方面：高血壓藥物、血膽甾醇過少藥（hypocholesteremic  agents )和免疫調節劑（immunomdulator)。

由于微生物細胞的內涵物及其周圍的培養基成分及其復雜，且所需的產物可能每毫升只有微微克到毫克這樣一個數量級，因此不管尋找哪一類生物活性物質，在選擇篩選方法時必須考慮選擇性和靈敏度兩個方面，即需要靈敏度很高的專一性檢測方法。

2.待篩選樣品的性質

尋找新產物的產生菌可用固體和液體培養基篩選。但次級代謝物的大規模生產是用沉沒培養法進行的，由于在固體培養基和液體培養基中產生的次級代謝物的方式不一樣，因此有些廠家以液體培養法為唯一的篩選手段。

3.篩選方案的設計

基本上可利用以下三種不同的篩選方法：①整體生物；②完整細胞；③亞細胞制劑。第一種是最直接的、在體內曬選活性物質的方法，但考慮到可處理的樣品少，費用高和篩選方法不夠靈敏。用這種方法作為初篩選是不妥的。