無菌均質器又叫拍打式均質器，或無菌均質機。

無菌均質器使從固體樣品中提取細菌的過程變得非常簡單，只需將樣品和稀釋液加入到無菌的樣品袋中，然后將樣品袋放入拍擊式均質器中即可完成樣品的處理。有效地分離被包含在固體樣品內部和表面的微生物均一樣品，確保無菌袋中混合全部的樣品。處理后的樣品溶液可以直接進行取樣和分析，沒有樣品的變化和交叉污染的危險。

無菌均質機一般采用304或316不銹鋼系統（大多數采用304），可有效的分離護體樣品表面和被包含在內的微生物均一樣品，樣品裝在一次性無菌均質袋中，不與儀器接觸。
無菌均質機具有均質柔和、樣品無污染、無損傷、不升溫、不需滅菌處理，不需洗刷器皿的特點，滿足快速、結果準確、重復性好的要求。
無菌均質機也適合腫瘤組織的勻漿，即可得到大量的單細胞，必要時，可通過延長均質時間，對組織細胞實現柔軟的破碎。

無菌均質機正確使用步驟：
1、把需處理的試品放入無菌均質袋中。
2、打開無菌均質機門(可全開啟)，將無菌袋開口在關閉無菌均質機門時夾住。
3、設定無菌均質機的使用程序(如拍擊速度、拍擊時間等)，進行拍擊均質工作。
4、實驗完畢后，打開無菌均質機門，取出樣品。

無菌均質機的使用如果做到以上幾點，可以極大延長其使用壽命和使用效果。