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RAA核酸擴增試劑應(yīng)用于恒溫核酸快速擴增

瀏覽次數(shù):1119 發(fā)布日期:2024-10-23  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
重組酶介導(dǎo)鏈置換核酸擴增(Recombinase-aid Amplification,RAA),是一種恒溫核酸快速擴增技術(shù)。RAA是利用從細菌或真菌中獲得的重組酶在常溫下可與引物DNA緊密結(jié)合,形成重組酶/引物復(fù)合體,侵入RNA-cDNA雙鏈核酸模板,在侵入位點重組酶將雙鏈打開,同時單鏈結(jié)合蛋白結(jié)合到被重組酶打開的單鏈上,維持雙鏈模板處于開鏈狀態(tài)。重組酶/引物復(fù)合體開始對雙鏈進行掃描,當引物在模板上搜索到與之完全匹配的互補序列時,重組酶/引物復(fù)合體解體,DNA聚合酶結(jié)合到引物的3’端,開始合成新鏈。合成的新鏈又可以作為模板,最終擴增產(chǎn)物以指數(shù)級增長,完成靶標基因的擴增,可用電泳法進行判讀。RAA凍干顆粒具有快速、靈敏度高以及特異性強等優(yōu)點,反應(yīng)組分已混合并冷凍干燥成核酸擴增試劑,操作簡便,易于保存。

檢測原理:

RAA凍干顆粒是基于重組酶介導(dǎo)鏈置換核酸擴增(Recombinase-aid Amplification,RAA)技術(shù)開發(fā)的恒溫核酸擴增檢測試劑,在39~42℃恒溫條件下特異識別并擴增目標樣本的核酸片段,可配合電泳法進行檢測判斷。

產(chǎn)品用途:

RAA凍干顆粒可應(yīng)用于核酸DNA 的快速擴增。

儲存及有效期:

本產(chǎn)品存儲于2~28℃、干燥、避光條件下,有效期為12 個月。

引物設(shè)計:

RAA核酸擴增技術(shù)對引物設(shè)計的要求與常規(guī)PCR引物設(shè)計有一定的區(qū)別。由兩條寡核苷酸組成一對引物,分別特異性識別一個核酸目標物的上下游核苷酸序列;引物長度在28-35 nt之間,序列中無回文序列、連續(xù)單堿基重復(fù)序列和內(nèi)部二級結(jié)構(gòu)區(qū);引物Tm值不作為設(shè)計時主要考慮因素。建議在開展RAA(基礎(chǔ)型)擴增反應(yīng)之前,先進行引物的篩選試驗,以便得到較高的檢測靈敏度。

探針設(shè)計建議方法:探針長度在46-52 nt之間,序列避免回文序列、內(nèi)部二級結(jié)構(gòu)和連續(xù)的重復(fù)堿基;探針的5’端用一種抗原標記物標記,通常為FAM基團或羧基熒光素;內(nèi)部含有堿基核苷酸類似物替換核苷酸(例如四氫呋喃殘基THF-有時稱為'dSpacer');3’末端有聚合酶延伸阻斷基團(例如C3-spacer,磷酸基或雙脫氧核苷酸)。如下圖所示:

注意:在開始實驗前檢查探針5’端標記的基團與下游引物5’端標記的基團是否與所用的試紙條相匹配;建議在開展 RAA試紙條型擴增反應(yīng)之前,先進行引物的篩選試驗,以便得到較高的檢測靈敏度。

產(chǎn)品說明:

1. 本產(chǎn)品是“Ready to Use”即用型 RAA凍干顆粒;含有除引物所有的反應(yīng)要素,如重組酶、DNA 聚合酶、逆轉(zhuǎn)錄酶、dNTP 、ATP和PEG 35000等。

2. 試劑盒最低檢測下限為 10-100copies/測試(依據(jù)引物篩選優(yōu)化程度和檢測手段)。

3. RAA試劑,僅擴增DNA。

4. 基礎(chǔ)型試劑,適用于電泳法分析條帶。

適用儀器:

恒溫金屬浴、恒溫水浴鍋。

檢測步驟:

1. 核酸樣本提取:請參考傳統(tǒng)DNA 提取方法或其他同效商品化試劑盒提取DNA樣本。

2. 操作步驟 

2.1 根據(jù)反應(yīng)數(shù)量,按照反應(yīng)體系配制含有水、上游引物(10 μM)、下游引物(10 μM)的 Mix,混合均勻后加入裝有核酸擴增試劑的檢測單元管中; 

2.2 向檢測單元管中加入經(jīng)步驟1處理得到的待測DNA樣本;

2.3 再向檢測單元管蓋上加入1.5~2.5 μL 的Mg2+,蓋上管蓋,上下顛倒 輕甩充分混勻5-6次,低速離心10 sec; (注:本步驟“是否充分混勻”將決定實驗結(jié)果的重復(fù)性) 

2.4 將檢測單元管放入37~40℃ 恒溫金屬浴(或恒溫水浴鍋)中,孵育30min。

結(jié)果分析與判定: 

可以根據(jù)瓊脂糖電泳、試紙條或熒光法判定實驗結(jié)果。

注意事項:

1. 試劑條檢測,推薦使用免開蓋的裝置進行試紙條檢測,避免氣溶膠污染。 

2. 開始檢測前請仔細閱讀本說明書全文,并嚴格按照要求進行操作。 

3.不同類型樣品所提取的核酸含量和純度有差異,可能導(dǎo)致擴增效率不同。 

4.當實驗室環(huán)境、試劑、儀器或配件存在陽性物質(zhì)(例如質(zhì)粒、擴增產(chǎn)物等)污染,或樣本間存在交叉污染的情況時,會影響檢測結(jié)果準確性,出現(xiàn)假陽性結(jié)果。

5. 務(wù)必保證試劑保存、配制或運輸?shù)卯敚駝t可能導(dǎo)致試劑檢測性能下降,出現(xiàn)假陰性結(jié)果。 

6. 陽性對照為質(zhì)粒,適用于評價本試劑核酸擴增性能。 

7. 請嚴格按照基因擴增實驗室的管理規(guī)范進行操作。 實驗結(jié)束后,檢測過程中所產(chǎn)生的廢棄物應(yīng)按照相關(guān)規(guī)范進行處理。

相關(guān)產(chǎn)品:

HP80201 基礎(chǔ)型RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80202 熒光型RAA 核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80203 基礎(chǔ)型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80204 熒光型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80205 試紙條型RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80206 試紙條型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

發(fā)布者:上海惠誠生物科技
聯(lián)系電話:18018625233
E-mail:17715331663@163.com

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