根據(jù)生物安全防護水平的差異，生物安全柜可分為一級、二級和三級三種類型。一級生物安全柜可保護工作人員和環(huán)境而不保護樣品。其氣流原理和實驗室通風櫥基本相同，不同之處在于排氣口安裝有HEPA 過濾器，將外排氣流過濾進而防止微生物氣溶膠擴散造成污染。一級生物安全柜本身無風機，依賴外接通風管中的風機帶動氣流。

二級生物安全柜是目前應(yīng)用最為廣泛的柜型。按照《中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準YY0569-2011生物安全柜》中的規(guī)定，二級生物安全柜依照入口氣流風速、排氣方式和循環(huán)方式可分為4 個級別：A1 型，A2型，B1 型和B2 型。所有的二級生物安全柜都可提供工作人員、環(huán)境和產(chǎn)品的保護。

A1型安全柜前窗氣流速度最小量或測量平均值應(yīng)至少為0.38m/s。70%氣體通過HEPA 過濾器再循環(huán)至工作區(qū)，30%的氣體通過排氣口過濾排出。

A2型安全柜前窗氣流速度最小量或測量平均值應(yīng)至少為0.5m/s。70%氣體通過HEPA 過濾器再循環(huán)至工作區(qū)，30%的氣體通過排氣口過濾排出。

二級B型生物安全柜均為連接排氣系統(tǒng)的安全柜。連接安全柜排氣導(dǎo)管的風機連接緊急供應(yīng)電源，目的在斷電下仍可保持安全柜負壓，以免危險氣體泄漏出實驗室。其前窗氣流速度最小量或測量平均值應(yīng)至少為0.5m/s(100fpm)。

B1型70%氣體通過排氣口HEPA 過濾器排除，30%的氣體通過供氣口HEPA 過濾器再循環(huán)至工作區(qū)。

B2型為100%全排型安全柜，無內(nèi)部循環(huán)氣流，可同時提供生物性和化學(xué)性的安全控制，可以操作揮發(fā)性化學(xué)品和揮發(fā)性核放射物作為添加劑的微生物實驗。

三級生物安全柜是為生物安全防護等級為4級實驗室而設(shè)計的，柜體完全氣密，工作人員通過連接在柜體的手套進行操作，俗稱手套箱(Golve box)，試驗品通過雙門的傳遞箱進出安全柜以確保不受污染，適用于高風險的生物試驗，如進行SARS、埃博拉病毒相關(guān)實驗等。過濾器是生物安全柜、超凈工作臺、通風柜等潔凈設(shè)備通風裝置的重要組成部分。ULPA超高效過濾器和HEPA高效過濾器這兩種空氣過濾器是專為去除氣流中絕大多數(shù)的極其小的顆粒污染物而設(shè)計的。這兩種過濾器可能在功能上是相似的，但二者的性能卻有著很大差異過濾器是生物安全柜、超凈工作臺、通風柜等潔凈設(shè)備通風裝置的重要組成部分。ULPA超高效過濾器和HEPA高效過濾器這兩種空氣過濾器是專為去除氣流中絕大多數(shù)的極其小的顆粒污染物而設(shè)計的。這兩種過濾器可能在功能上是相似的，但二者的性能卻有著很大差異

兩者最主要的區(qū)別在于截留效率不同，HEPA對0.3μm的微粒、煙霧和微生物等塵埃粒子的過濾效率達到99.97%以上；ULPA對0.1-0.2μm的微粒、煙霧和微生物等塵埃粒子的過濾效率達到99.999%以上，對0.3μm顆粒更是達到了99.9999%以上。