化學實驗室經常會產生某些有毒的氣體，液體或廢渣需要處理，特別是某些劇毒物質，如果直接排出就可能污染周圍的空氣和水源，造成環境污染，損害人體健康。因此對廢液、廢氣和廢渣要經過一定的處理后，才能排棄。嚴禁將濃酸、濃堿廢液和不能溶固體物質倒入水池，以防堵塞和腐蝕水管。化學實驗室的“三廢”排放應做到以下幾點：
    一. 廢氣：產生少量有毒氣體的實驗室應在通風柜中進行，通過排風設備將少量毒氣排到室外。產生毒氣量較大的實驗室必須有吸收或處理裝置。如 NO2、SO2、H2S、HF 等可用導管通入堿溶液中，以使其大部分被吸收后排出，CO可點燃使其生成CO2。
    二. 廢渣：少量有毒的廢渣，應安排指定地點并深埋于地下。
    三. 廢液：廢液的處理與其性質有關，不同的廢液處理方法不同。如廢硫酸液可先用廢堿液和堿液中和，調制pH6-8，然后從水道排出。含酚、氰、汞、鉻、砷的廢液經以下處理才能排放，具體辦法如下：
    1 酚：高濃度的酚可用己酸丁酯萃取，重蒸餾回收。低濃度的酚廢液可加入次氯酸鈉或漂白粉使酚氧化為二氧化碳和水。
    2 氰化物：含有氰化物的廢液不得直接倒入實驗室水池內，應加入氫氧化鈉使呈鹼性后再倒入硫酸亞鐵溶液中（按質量計算：1份硫酸亞鐵對1份氫氧化鈉），生成無毒的亞鐵氫化鈉再排入下水管道。

    3 汞：若不小心將金屬汞散落在實驗室內，必須立即用吸管、毛筆或硝酸汞溶液浸過的薄銅片將所有的汞滴揀起，收集于適當的瓶中，用水覆蓋起來。散落過汞的地面應撒入硫磺粉，將灑落區覆蓋一段時間，使其生成硫化汞，再設法掃凈，也可噴灑20%的三氯化鐵溶液，讓其自行干燥后再清掃干凈。
    含汞鹽的廢液，可先調節pH至8-10，加入過量硫化鈉，使其生成硫化汞沉淀，再加入硫酸亞鐵作為沉淀劑，清夜可以排放，殘渣可以用焙燒法回收汞，或再制成汞鹽。
    4 鉻：鉻酸洗液如失效變綠，可濃縮冷卻后加高錳酸鉀粉末氧化，用砂心漏斗濾去二氧化錳后再用。失效的廢洗液可用廢鐵屑還原殘留的六價格，再用廢堿液或石灰中和使其生成低毒的氫氧化鉻沉淀。
    5 鎘：用石灰將廢液調到pH8-10，使廢液中鉛、鎘生成氫氧化物沉淀，加入硫酸亞鐵，作為共沉淀劑。
    6 合廢水的處理：實驗室的混合廢液可用鐵粉法處理，此法操作簡單，沒有相互干擾，效果良好，處理方法是用酸調節廢水至pH3-4，加入鐵粉，攪拌0.5h，用堿再調至pH9左右，繼續攪拌10min，再加入高分子混凝劑，進行混凝后沉淀，清液可排放，沉淀物以廢渣處理。