是一種型跨膜糖蛋白，由199個氨基酸組成，包括40個殘基的細胞內區，21個殘基的跨膜區和138個殘基的細胞外區 細胞外區有特征性的Ca2+依耐性糖基識別區域 CD69通常以同源二聚體形式存在，由分子量為28kD和32kD的2條鏈經二硫鍵連接，這2條鏈由分子量為22.5kD的多肽鏈通過不同的糖基化組成。

CD69自被發現后，其初始研究基本上是關于它在細胞活化中的作用 CD69可在幾乎所有髓系細胞中表達 但除了在血小板和單核細胞中有持續的低水平表達外，CD69在其它細胞靜止狀態下并不表達，而是在細胞激活后表達 早期的研究主要集中于它在T細胞和NK細胞中的表達，誘導CD69表達的機制主要是PKC的激活和細胞內Ca2+水平的持續增高，阻斷PKC通路可直接抑制CD69的表達。CD69在活化細胞中的快速表達并不僅僅作為一個標記分子，事實上，它更重要的作用是作為細胞共刺激信號進一步增強細胞的活化或增殖分化

雖然CD69在細胞活化中的有著重要作用，但近年來的研究顯示，CD69的表達在體內與細胞的凋亡密切相關。在體內活化的具有CD69高表達的T細胞在體外易于快速自發凋亡，CD69-/-小鼠腹腔和脾中淋巴細胞存活率增高，凋亡明顯減少，脾淋巴細胞在激活后的凋亡明顯低于野生型小鼠，并有凋亡信號caspase-3的活化減少。研究發現PMA刺激后CD69高表達的Eos亦有凋亡的顯著增加；國外有人在Eos體外培養時，加入antiCD69mAb可增加細胞凋亡，伴有抗凋亡信號B細胞淋巴瘤/白血病-2( B-cell leukemia-lymphoma,bcl-2) 表達下降的報道，且CD69與抗體的交聯所誘導的Eos凋亡并不受周圍環境中GM-CSF的影響。可由CD69介導的凋亡細胞主要為活化的嗜酸性粒細胞和單核細胞。關于CD69介導細胞凋亡的分子機制仍不明確研究顯示CD69介導的單核細胞凋亡與3個不同的信號通路相關: ( 1) 依賴于NO；(2)與磷脂酶A2/磷脂氧化酶級聯反應相關；(3)受百日咳毒素( PTX)敏感的G蛋白影響，且三者都是誘導單核吞噬細胞凋亡的必要不充分條件。