UMI Small RNA測(cè)序，文庫(kù)構(gòu)建時(shí)引入特異性分子標(biāo)簽（UMI），結(jié)合高通量測(cè)序，研究某物種某組織在特定時(shí)空狀態(tài)下18-30 nt的small RNA片段序列信息，實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)定量，通過(guò)與數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì), 可實(shí)現(xiàn)small RNA序列的鑒定、靶基因分析和功能分析， 以及包含miRNA、siRNA、piRNA等多種small RNA類型的分析研究需求等。主要應(yīng)用在動(dòng)植物生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控研究、抗病抗逆調(diào)控研究、生物性狀及突變調(diào)控研究等；在疾病研究方面，可研究疾病發(fā)生調(diào)控機(jī)制、尋找生物標(biāo)記、靶向藥物研究等。

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

1.  實(shí)驗(yàn)方法升級(jí)，數(shù)據(jù)庫(kù)更新，sRNA定量結(jié)果更可靠

建庫(kù)引入U(xiǎn)MI技術(shù)，實(shí)現(xiàn)無(wú)偏向的精確定量，矯正原有70%的reads定量偏差；采用權(quán)威miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)、KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)；

2.  實(shí)驗(yàn)技術(shù)經(jīng)驗(yàn)豐富，低起始量成功率高，技術(shù)重復(fù)性高

已完成350多種不同物種的項(xiàng)目，常規(guī)樣本單次建庫(kù)只需100ng，血清血漿樣本只需20ng；小RNA樣本實(shí)現(xiàn)最低1 ng起始量；低起始量建庫(kù)成功率達(dá)95%；建庫(kù)、測(cè)序技術(shù)重復(fù)性高；

3.  多樣的樣品類型，滿足多角度研究需求

接收除常規(guī)樣品以外的血清、血漿樣品、組織液樣品、FFPE樣品、外泌體、RIP富集RNA等多種類型；

4.  Dr.Tom系統(tǒng)交付，多種個(gè)性化分析任您選

采用Dr.Tom多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)，10大數(shù)據(jù)庫(kù)注釋，多維度結(jié)果圖片展示，數(shù)據(jù)圖表循環(huán)挖掘；

5.  無(wú)憂解決售后

可根據(jù)客戶需求進(jìn)行貼身個(gè)性化服務(wù)，為文章撰寫(xiě)提供技術(shù)服務(wù)。

研究?jī)?nèi)容
利用DNBSEQ平臺(tái)，對(duì)富集到的18-30nt的小RNA片段進(jìn)行測(cè)序，對(duì)獲得的有效數(shù)據(jù)進(jìn)行序列長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì)，將篩選后的高質(zhì)量序列分類注釋，從而獲得樣品中包含的各組分及表達(dá)量信息，并對(duì)所有小RNA片段進(jìn)行注釋，對(duì)miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè)等分析。

標(biāo)準(zhǔn)信息分析

1.  數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)，對(duì)原始信息采集數(shù)據(jù)去接頭污染，去低質(zhì)量reads

2.  small RNA 信息采集結(jié)果的長(zhǎng)度分布

3.  small RNA在選定的參考基因組上的分布

4.  small RNA分類統(tǒng)計(jì)

5.  miRNA定量分析

6.  miRNA差異表達(dá)分析

7.  miRNA表達(dá)/差異表達(dá)聚類分析

8.  miRNA靶基因分析

9.  差異miRNA 靶基因GO 注釋和KEGG 通路分析

高級(jí)信息分析

一）數(shù)據(jù)庫(kù)注釋

1. 轉(zhuǎn)錄因子注釋（AnimalTFDB/PlantTFDB）

2. GSEA分析

3. Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro數(shù)據(jù)庫(kù)注釋

二）互作網(wǎng)絡(luò)分析

1. 靶基因分析

① miRNA-mRNA靶向關(guān)系分析

② lncRNA-mRNA靶向關(guān)系分析

2. ceRNA互作網(wǎng)絡(luò)分析

3. 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析

4. 共表達(dá)互作網(wǎng)絡(luò)分析

三）特色分析

1. 外部數(shù)據(jù)庫(kù)關(guān)聯(lián)分析（TCGA、ARCHS4）

2. 關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)基因網(wǎng)絡(luò)圖分析

華大科技于2012年完成整合，致力于成為全球生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)的首選科技服務(wù)商，為從事生命科學(xué)研究的機(jī)構(gòu)和企業(yè)提供高質(zhì)量、行業(yè)領(lǐng)先的基因測(cè)序、質(zhì)譜、合成生物學(xué)、生物數(shù)據(jù)庫(kù)、云計(jì)算等標(biāo)準(zhǔn)化的技術(shù)服務(wù)和綜合的全流程解決方案。 目前，公司服務(wù)已經(jīng)覆蓋了全球100多個(gè)國(guó)家和地區(qū)，擁有7,000多位合作單位，為25,000多位行業(yè)聯(lián)系人提供了杰出技術(shù)支撐與服務(wù)，更通過(guò)深度合作完成了一系列大型基因組科研計(jì)劃和國(guó)際多邊合作項(xiàng)目。科研積累上，截至2020年9月底，公司累計(jì)參與發(fā)表近1,500篇文章，其中CNNS 120+。截止2022年3月，華大自主測(cè)序平臺(tái)DNBSEQTM 助力發(fā)表2,013+篇高質(zhì)量文章，影響因子合計(jì)8,800+，并實(shí)現(xiàn)CNS三大主刊發(fā)文。