與植物和動物代謝組學相比，微生物在生長培養基中濃度較低，具有低濃度代謝物難于檢測，胞內和胞外代謝物不易分離等特點。微生物代謝組學主要進行胞內代謝物的分析，由于細胞內的酶系活躍、代謝物轉換迅速,因此取樣和樣品制備的方法會顯著影響分析結果的準確性和重復性。

滅活過程中如何保持細胞的完整性, 防止胞內代謝物的泄漏, 以正確反映微生物細胞的生理狀態, 是微生物代謝組學研究的關鍵。目前還沒有通用的微生物淬滅和代謝物提取的方法，根據不同的微生物特性選擇合適的淬滅方法在微生物代謝組學研究中非常重要。

淬火的方法一般有：

超濾性膜快速過濾后立即冰凍細胞；

用高氯酸稀釋細胞；

在-45℃甲醇溶液中稀釋細胞；

培養基置入液氮快速冷凍、解凍、離心收集細胞；

用帶有預冷的不銹鋼珠的注射器迅速取樣、過濾收集細胞。

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微生物代謝組學平臺：
 

 微生物樣本：

公司介紹:上海百趣生物醫學科技有限公司（簡稱百趣生物）成立于2013年4月，是一家專業提供生命科學前沿研究技術應用、咨詢及開發的高新技術企業。百趣生物專注于創新質譜技術在生命科學研究與醫學健康兩大領域的應用，尤其在生命科學研究領域，公司在國內市場獲得了優秀的口碑。自成立以來，百趣生物相繼被認定為國家高新技術企業、高新技術成果轉化項目、上海市科技型中小企業技術創新資金資助項目，百趣實驗室相繼取得了病原微生物實驗室BSL-2備案、CMA認證。公司目前已經建立并完善的代謝組學平臺，包括非靶標代謝組、高通量靶標代謝組、常規靶標代謝組、脂質組學、代謝流檢測，同時建立了蛋白質組學平臺，提供靶向及非靶向蛋白組學、修飾蛋白質組學、多肽組學等業務。

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