lncRNA測序

long non-code RNA sequencing

使用高通量測序技術結合最新的生物信息學分析平臺，助您全面深入地開啟lncRNA研究。

服務類別：	測序/合成	總訪問：	890
最后更新：	2014-1-15	半年訪問：	3
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服務商：杭州聯川生物信息有限公司

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在最近十余年的生命科學研究中，對具有重要調控功能的非編碼RNA的研究可謂是其中最引人關注的領域之一，而長鏈非編碼RNA（long non-coding RNAs，lncRNAs）一經登場，便迅速成為非編碼RNA界又一個耀眼的明星。lncRNAs是一類長度大于200 nt的非編碼RNA，廣泛存在于各種生物體內，在表觀遺傳、轉錄以及轉錄后等多種水平上對生命活動進行關鍵性的調控，與動植物的生長發育，人類的疾病發生有著密切關系，也可作為疾病診斷的標志物或是重要靶點。聯川生物推出的lncRNA測序服務，使用高通量測序技術結合最新的生物信息學分析平臺，助您全面深入地開啟lncRNA研究。

	采用核糖體去除技術和鏈特異性文庫構建方案，保留了完整的lncRNA和mRNA序列，以及序列方向性。
	對包括人和動植物在內的許多物種的lncRNA展開分析。
	對樣本中幾乎全部的lncRNA和mRNA序列進行鑒定和分析。
	系統收集lncRNA數據庫用于鑒定已知lncRNA，并設置嚴格的篩選條件用于發現新lncRNA。
	展開lncRNA與mRNA的關聯分析，深入分析lncRNA調控網絡。

Gut ：利用測序技術研究 lncRNA 對食管癌增殖與轉移的調控作用

本研究采用RNA-Seq技術，對食管腺癌組織和配對的正常組織中的lncRNA進行鑒定和差異表達分析。共發現6216個lncRNAs在食管腺癌組織中表達，其中lncRNA HNF1A-AS1顯著過表達。敲除HNF1A-AS1能抑制食管腺癌細胞的增殖與轉移，并抑制癌癥相關lncRNA H19的表達。研究表明，HNF1A-AS1的失調參與了食管癌的發生，而該參與過程有可能部分受到染色質與核小體組裝的改變及H19誘導的調節。

Yang X. et al.（2013）Long non-coding RNA HNF1A-AS1 regulates proliferation and migration in oesophageal adenocarcinoma cells. Gut. doi: 10.1136/gutjnl-2013-305266.

New Phytol ：利用測序技術研究擬南芥 lncRNA 應答尖孢鐮刀菌侵染的分子機制

尖孢鐮刀菌（F. oxysporum）是一種世界性分布的土傳病原真菌，寄主范圍廣泛，可引起包括擬南芥和重要經濟作物如棉花和番茄等100多種植物發生枯萎病，造成嚴重損失。
本研究采用鏈特異性RNA-Seq技術，對擬南芥中應答F. oxysporum侵染的lncRNA展開分析。實驗發現許多與F. oxysporum侵染應答相關的lncRNA，包括15個長鏈非編碼天然反義轉錄本（lncNATs）和20個lincRNAs。實驗證實上述部分的lncNATs和lincRNAs與擬南芥的F. oxysporum抗性密切相關。研究表明，鏈特異性RNA-Seq是發現隱藏著的轉錄組的有力工具，并證實lncRNAs是擬南芥抗真菌網絡中重要的節點。

Zhou QK.（2013）Long noncoding RNAs responsive to Fusarium oxysporum infection inArabidopsis thaliana. New Phytology. DOI: 10.1111/nph.12537

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