在生物醫(yī)學(xué)研究的前沿，單細(xì)胞測序技術(shù)已經(jīng)為我們打開了一扇窗，讓我們得以窺見細(xì)胞的微觀世界。然而，隨著科技的飛速發(fā)展，單細(xì)胞空間多組學(xué)技術(shù)正悄然崛起，它不僅能夠揭示單個細(xì)胞的基因表達(dá)，還能告訴我們這些細(xì)胞在組織中的具體位置。

那么，這是否意味著單細(xì)胞空間多組學(xué)將逐步替代傳統(tǒng)的單細(xì)胞測序技術(shù)呢？

曾經(jīng)的革命與升起的新星，

替代還是互補(bǔ)？

單細(xì)胞空間多組學(xué)是否會替代單細(xì)胞測序呢？目前看來，這兩種技術(shù)各有優(yōu)勢，它們更可能是互補(bǔ)而非替代關(guān)系。單細(xì)胞測序在某些研究場景下仍然是不可或缺的，尤其是在需要高通量基因表達(dá)分析的情況下。而單細(xì)胞空間多組學(xué)則在需要空間信息的場合展現(xiàn)出其獨(dú)特的價值。目前來看，想要進(jìn)行更深入的研究，獲得可靠成果，同時選用兩個甚至多個組學(xué)平臺，使研究內(nèi)容能夠相互佐證、相互補(bǔ)充十分必要。

單細(xì)胞空間原位產(chǎn)品——CosMx™ Human 6K Discovery Panel

作為單細(xì)胞空間原位技術(shù)的代表性平臺，CosMx™ Human 6K Discovery Panel共包含人6180個蛋白質(zhì)編碼的RNA基因，幾乎覆蓋了整個Reactome數(shù)據(jù)庫，接近已知的全部生物學(xué)通路。

在NanoString所公布的6K panel具體檢測結(jié)果中我們可以看到，研究人員檢測了八種不同組織類型的FFPE切片，包括人類的腦、皮膚、肺、乳腺、肝臟、結(jié)腸、胰腺和腎臟。對于每一張組織切片還同時檢測了四種蛋白質(zhì)形態(tài)學(xué)marker和DAPI，以識別組織形態(tài)并提高細(xì)胞分割的準(zhǔn)確性。此外，研究團(tuán)隊還開發(fā)了三級分析算法，用于細(xì)胞分型、配體-受體分析、基因和配體共定位分析、細(xì)胞間相互作用和通路分析。

利用CPA樣本分析CosMx 1K和CosMx 6K中共有靶標(biāo)的檢測結(jié)果表明，這兩種檢測方案具有很強(qiáng)的一致性。

對于CosMx™ SMI 1000 gene panel，SBC也發(fā)布了實測數(shù)據(jù)結(jié)果。

從測試數(shù)據(jù)來看，在樣本選取的40個FOV中，檢測到的細(xì)胞數(shù)達(dá)到17萬多，檢測到的總轉(zhuǎn)錄本數(shù)超過35M，平均單個細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄本約210條，單個細(xì)胞最高基因檢出數(shù)為564，靈敏度高且特異性表現(xiàn)較好。

（更多詳情點擊：實測數(shù)據(jù)結(jié)果展示 | SBC順利完成首批CosMx™ SMI空間原位分析實驗！）

未來展望

隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步，我們可以預(yù)見，單細(xì)胞空間多組學(xué)將在未來的研究中扮演越來越重要的角色。它將幫助我們更深入地理解生物系統(tǒng)的復(fù)雜性，推動個性化醫(yī)療和精準(zhǔn)治療的發(fā)展。同時，我們也期待單細(xì)胞測序技術(shù)能夠與空間多組學(xué)技術(shù)相結(jié)合，為我們提供更加全面和深入的生物學(xué)見解，并且能夠在分辨率、靶標(biāo)數(shù)和敏感性等方面不斷提升。

結(jié)語

在科研的道路上，每一次技術(shù)的革新都是對未知世界的一次探索。單細(xì)胞空間多組學(xué)技術(shù)的興起，不僅為我們提供了新的研究工具，也為我們打開了新的科學(xué)視野。讓我們拭目以待，看這兩種技術(shù)如何共同推動生命科學(xué)的新篇章。