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TMT技術(shù)在蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用與分析方法

瀏覽次數(shù):873 發(fā)布日期:2024-2-29  來源:百泰派克生物科技

TMT(Tandem Mass Tags)技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中用于蛋白質(zhì)定量分析的一種先進(jìn)方法。TMT標(biāo)記涉及使用一系列重量不同的化學(xué)標(biāo)簽,這些標(biāo)簽可以結(jié)合到肽段的氨基末端和側(cè)鏈上。通過這種方法,可以同時(shí)處理多個樣本,然后將它們混合在一起進(jìn)行質(zhì)譜分析。TMT技術(shù)允許多達(dá)16個不同的樣品同時(shí)進(jìn)行定量分析,使其成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的一個強(qiáng)大工具。這種技術(shù)的關(guān)鍵優(yōu)勢在于其能夠提供高通量、高靈敏度和高準(zhǔn)確性的蛋白質(zhì)表達(dá)水平比較。TMT圖譜的特點(diǎn)和分析過程包括:

1.樣品標(biāo)記:

 

TMT標(biāo)記涉及將不同的化學(xué)標(biāo)簽連接到樣品中的肽段上。每個標(biāo)簽具有相同的質(zhì)量和結(jié)構(gòu),但在重同位素的組成上略有不同,從而在質(zhì)譜分析中產(chǎn)生不同的信號。

2.樣品混合和色譜分離:

 

標(biāo)記后的樣品被混合在一起,然后通過液相色譜(LC)分離。

3.質(zhì)譜分析:

 

分離的肽段通過質(zhì)譜儀進(jìn)行分析。在質(zhì)譜儀中,TMT標(biāo)記的肽段首先產(chǎn)生前體離子信號,然后在碰撞誘導(dǎo)解離(CID)或高能碰撞解離(HCD)下分裂,產(chǎn)生獨(dú)特的標(biāo)記離子。

4.定量分析:

 

TMT標(biāo)記產(chǎn)生的報(bào)告離子在質(zhì)譜圖中用于定量分析。通過比較不同標(biāo)簽的報(bào)告離子的強(qiáng)度,可以定量比較各個樣品中的蛋白質(zhì)表達(dá)水平。

5.數(shù)據(jù)處理和生物信息學(xué):

 

數(shù)據(jù)處理包括對齊、峰識別、定量分析以及與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的匹配。

生物信息學(xué)分析用于鑒定蛋白質(zhì)、進(jìn)行功能注釋和生物學(xué)通路分析。

圖1.基于TMT的蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)工作流程

TMT技術(shù)的生物學(xué)意義

 

鑒定和定量后的數(shù)據(jù)用于進(jìn)一步的生物信息學(xué)分析,如功能注釋、通路分析和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。
這些分析有助于理解蛋白質(zhì)表達(dá)變化的生物學(xué)含義,如疾病機(jī)理、生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)或藥物作用的研究。

TMT技術(shù)因其高度的靈敏度和適用于大規(guī)模比較分析的能力,在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中越來越受到重視,特別是在疾病機(jī)理研究、藥物開發(fā)和生物標(biāo)志物篩選等領(lǐng)域。

發(fā)布者:北京百泰派克生物科技有限公司
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