各位看官大家好！空間代謝組Q&A又和大家見面啦！上一期，我們介紹了空間代謝組學的工作流程及樣本準備小技巧（點擊閱讀）。這一期，我們將為大家繼續解答數據處理中的常見小問題

Q1 深度空間代謝組學如何進行數據處理方式是什么？
深度空間代謝組學的原始數據通過SCILS^TM Lab軟件處理。SCILS^TM Lab是由Bruker公司針對空間代謝組學數據特點而開發的商業化質譜成像分析軟件。該軟件很好地解決了傳統數據處理中，涉及空間和高維代謝組信息整合時，難以準確展現真實分子層面的變化的痛點。目前該軟件被廣泛使用，堪稱分析利器。

Q2 SCILS^TM Lab的優勢是什么？
1.  內部邏輯穩定，集成完整質譜數據標準化與成像分析功能，輸出數據可追溯；
2.  集成下一代機器學習集成算法，支持臨床大隊列分析比較，多樣本/多區域/3D成像整合處理；
3.  高效的譜圖解析功能，可實現深度挖掘關鍵代謝物信息；
4.  可視化操作，數據隨時可調，快速交付。

Q3 深度空間代謝組分析是如何進行代謝物定性的？
傳統空間代謝組學定性指標有兩種，分別是MS1(一級質譜)和MS2（二級質譜）。在新一代空間代謝組學技術中，利用離子淌度捕集裝置，針對離子橫截面積不同的特點進行分離，形成第三個定性指標CCS值。深度空間代謝組學基于tims-TOF flex MALDI 2開發，可以根據實驗需求，結合中科本地標準品數據庫以及Bruker商業代謝物數據，實現上述三種指標的定性分析，大幅提升代謝物鑒定準確性。

Q4 深度空間代謝組學數據分析結果示例