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乙;揎椀鞍捉M揭示糖基轉(zhuǎn)移酶乙;谧冃捂溓蚓锬さ淖饔

瀏覽次數(shù):1123 發(fā)布日期:2021-11-23 

 
文章標(biāo)題:Quantitative acetylome analysis reveals involvement of glucosyltransferase acetylation in Streptococcus mutans biofilm formation
發(fā)表期刊:Environ Microbiol Rep
發(fā)表時(shí)間:2021年4月13日
主要技術(shù):乙酰化修飾蛋白組學(xué)
樣本類(lèi)型:細(xì)菌


| 摘要

變形鏈球菌能有效地利用食物中的蔗糖產(chǎn)生胞外多糖,而胞外多糖主要是通過(guò)糖基轉(zhuǎn)移酶(Gtfs)的作用合成的。本研究對(duì)變形鏈球菌的乙酰化修飾蛋白進(jìn)行了鑒定,并對(duì)變形鏈球菌生物膜生長(zhǎng)(SMB)和浮游生物膜生長(zhǎng)(SMP)的乙;揎椀鞍走M(jìn)行了定量分析,采用TMT標(biāo)記和Kac親和富集結(jié)合高分辨率質(zhì)譜定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法定量蛋白質(zhì)乙;膭(dòng)態(tài)變化,共鑒定了445個(gè)蛋白中的973個(gè)乙;稽c(diǎn),其中定量了302個(gè)蛋白中的617個(gè)乙酰化位點(diǎn)。

總體分析表明,22.7%的蛋白質(zhì)發(fā)生了乙;。在SMB的定量蛋白中,有56個(gè)位點(diǎn)賴(lài)氨酸的乙酰化程度升高,52個(gè)位點(diǎn)賴(lài)氨酸的乙;潭冉档。在變形鏈球菌的乙酰基組中,鑒定得到6個(gè)顯著富集的基元,分別為Kac****K、KacF、Kac****R、KacY、KacH、F*Kac。此外,基于KEGG途徑的富集分析表明,糖酵解/糖異生和RNA降解顯著富集。特別是在變形鏈球菌生物膜中,乙酰化賴(lài)氨酸蛋白下調(diào)最多的是葡糖基轉(zhuǎn)移酶- SI、葡糖基轉(zhuǎn)移酶- I和葡糖基轉(zhuǎn)移酶- S,這可能揭示了生物膜發(fā)育過(guò)程中葡糖基轉(zhuǎn)移酶功能調(diào)控的關(guān)閉機(jī)制。


 | 研究結(jié)果


1.對(duì)突變鏈球菌中所有已鑒定的賴(lài)氨酸乙;鞍走M(jìn)行綜合分析
通過(guò)LC-MS/MS檢測(cè)變形鏈球菌中發(fā)生乙;揎椀牡鞍,共鑒定出445個(gè)蛋白中973個(gè)乙;稽c(diǎn),其中306個(gè)蛋白中617個(gè)乙;稽c(diǎn)進(jìn)行了定量分析。其中有56個(gè)位點(diǎn)賴(lài)氨酸的乙;潭壬,52個(gè)位點(diǎn)賴(lài)氨酸的乙酰化程度降低。

2. 變形鏈球菌乙酰化蛋白的亞細(xì)胞定位和功能分布
變形鏈球菌和浮游相比,對(duì)其差異的乙;鞍走M(jìn)行亞細(xì)胞定位和功能分析,其中變形鏈球菌85%的乙;鞍追植荚诩(xì)胞質(zhì)中,15%分布在膜中,而浮游生物中乙酰化蛋白55%分布在細(xì)胞質(zhì)中,24%分布在細(xì)胞外空間,21%分布在膜中。根據(jù)功能分布,變形鏈球菌中17%的乙;鞍讌⑴c代謝過(guò)程,17%參與細(xì)胞過(guò)程,17%參與結(jié)合,14%參與催化活性,12%參與細(xì)胞。上述結(jié)果表明,賴(lài)氨酸乙;鞍自谧冃捂溓蚓袕V泛分布,提示乙;揎椏赡茉谏锬ば纬芍衅鹬匾恼{(diào)控作用。

 


 

3. 在浮游和變形鏈球菌生物膜細(xì)胞中差異乙;鞍椎墓δ芨患
為了研究乙酰化修飾是否改變蛋白的功能,進(jìn)行了基于GO的富集分析。在碳水化合物代謝和分解代謝,以及葡聚糖代謝過(guò)程均顯著富集在調(diào)控蛋白中;贙EGG通路對(duì)調(diào)控蛋白(SMB vs SMP)的富集分析表明,顯著的富集是糖酵解/糖異生和RNA降解。將各乙;牡腟MB/SMP TMT比值轉(zhuǎn)化為z-score,根據(jù)25%、50%、75%三個(gè)不同百分位的正態(tài)分布累積密度函數(shù)設(shè)置z-score的截止值。定量結(jié)果顯示,大部分乙;鞍追植荚赒2(25 50%)和Q3(50 75%)分位數(shù)中。

 



4. WB 驗(yàn)證
對(duì)差異乙;鞍椎亩糠治霰砻鳎谧冃捂溓蚓锬ぶ校阴;(lài)氨酸蛋白下調(diào)最多的是葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶-SI、葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶- I和葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶-S。通過(guò) WB 驗(yàn)證乙;揎椝,與浮游生物生長(zhǎng)相比,變形鏈球菌生物膜中的乙;咸烟腔D(zhuǎn)移酶顯著下調(diào)。


 | 研究結(jié)論

在變異鏈球菌中鑒定了445個(gè)蛋白中973個(gè)乙;稽c(diǎn)。其中22.7%的蛋白質(zhì)發(fā)生了乙酰化,主要發(fā)生在6個(gè)顯著富集的基元上,如Kac****K、KacF、Kac****R、KacY、KacH和F*Kac。

總的來(lái)說(shuō),在生物膜階段乙;鞍椎臄(shù)量增加。而乙;/去乙酰化改變的蛋白質(zhì)主要參與糖代謝和分解代謝,以及葡聚糖的代謝過(guò)程。特別是變形鏈球菌生物膜中乙;较抡{(diào)最多的蛋白,如葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶- SI、葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶- I和葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶- S,可能促進(jìn)生物膜的形成。這些糖基轉(zhuǎn)移酶可能是齲齒治療的潛在靶點(diǎn)。

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發(fā)布者:上海百趣生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
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