控制模式（CV）：呼吸機完全替代實驗動物的呼吸，其呼吸頻率，潮氣量均由呼吸機控制，屬于完全的呼吸支持。適用于自主呼吸消失或很微弱的情況，比較典型的應用，就是動物的開胸手術實驗。 根據控制參數的不同，控制通氣又可以分為容量控制通氣(VCV）和壓力控制通氣(PCV)。容量控制通氣(VCV）是呼吸機按預置的潮氣量、呼吸頻率、呼吸比等參數完成通氣。 壓力控制通氣(PCV)則是呼吸機按照預置的頻率、呼吸比、吸氣壓力工作。

 輔助通氣（AV）: 呼吸機的送氣是通過呼吸機檢測實驗動物的氣道壓的降低來觸發。輔助通氣是一種與臨床應用類似的呼吸方式，動物的輔助通氣一般可以通過設置壓力觸發、人工觸發或定時觸發等方式啟動。對于動物呼吸機而言，輔助通氣(AV）是一種較高級的呼吸模式，僅少量動物呼吸機具體此功能。

嘆氣模式(sigh): 是一種在常規呼吸通氣條件下，隔一段時間進行一次深呼吸的通氣方式。通常實驗動物在長期使用控制通氣，尤其是容量控制通氣條件下，某些邊緣肺泡會膨脹不全，肺部功能會逐步減弱，加入定時或手工嘆氣，可防止肺部萎陷不張，改善氣體交換性能。

一、實驗動物部分生理參數，作為動物生理參數實驗監護的參考值：

二、氣管插管

 氣管插管是為了在動物手術過程中保持動物呼吸道順暢,減少動物窒息死亡的常用手術。

 同時氣管內插管還可用于氣管內給藥治療研究。氣管插管對犬、豬等大動物操作過程相對容易,對嚙齒類動物相對較難，是動物呼吸機輔助呼吸的重要步驟。在某些需要呼吸機 輔助呼吸的實驗中，順利的氣管插管是實驗成敗的關鍵之一。 氣管插管推薦使用靜脈留置針的套管:大鼠一般使用14-18G插管， 小鼠一般使用20-24G插管。

不同的實驗室采用不同的插管技術，目前所使用的有：

 1、切氣管，直接插管法

 2、切氣管，逆行導絲法

 3、 經口插管，盲插法

 4、經口插管，透射光輔助法

 5、經口插管，光纖輔助法

三、選擇通氣模式:選擇壓力控制模式或者容量控制模式。

采用壓控模式相對安全，因為不會過度充脹動物的肺，也不會對“脆弱”的肺造成傷害；參數容易設置和操作，而不用管動物的肺的容積和柔韌度；然而，若實驗時間很長（通常超過1小時，很有可能在動物的氣道積聚分泌物或其它阻塞物，導致吸氣提前終止（此時需疏通氣管和氣道）。

容控模式則適合長時間實驗，因為它總是輸送一定量體積的氣體至動物的肺部，不會引起動物的肺的柔韌度變化；然而，參數的預設置相對復雜，需確定氣體流量和吸氣時間（或吸呼比），一旦這兩個參數設定，若想對呼吸的狀態隨時進行調整就很容易，只需簡單地升高或降低氣體流量，這樣，可精細地調節動物的呼吸以維持較恒定的CO2分壓。

總之，壓控模式設置快速、操作安全，適用于短時間的動物實驗和呼吸機初級使用者；容控模式設置相對復雜，但可精細調節動物的呼吸，適合長時間的動物實驗。

如選擇容積控制模式，根據如下參考，選擇相對應的動物的潮氣量和呼吸頻率。

呼吸未正壓(PEEP):在呼氣末氣道開放時，氣道壓力仍保持高于大氣壓，防止肺泡萎縮塌陷，一般開胸手術需要設置PEEP，設置的范圍是為3-125pxH2O。

吸/呼比（I/E Ratio)：吸氣與呼氣時間的比例，一般設置為1/2，某些活塞式呼吸機這個參數不可設置，相當于1/1。

呼吸機的設置就完成了，可以進行下一步實驗操作了。