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經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué)增加保留時(shí)間算法實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)定性

瀏覽次數(shù):2274 發(fā)布日期:2021-2-3  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

假陽性峰多?

脂質(zhì)數(shù)量不準(zhǔn)確?

定性結(jié)果有疑點(diǎn)?
你了解的常規(guī)非靶脂質(zhì)組檢測(cè)是怎樣的呢?會(huì)不會(huì)有以上情況發(fā)生。下面就讓我來告訴你這些問題如何解決吧~


01
經(jīng)典脂質(zhì)組​

 

脂質(zhì)組學(xué)(lipidomics)是對(duì)生物體、組織或細(xì)胞中的脂質(zhì)以及與其相互作用的分子進(jìn)行全面系統(tǒng)的分析、鑒定,了解脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,進(jìn)而揭示脂質(zhì)代謝與細(xì)胞、器官乃至機(jī)體的生理、病理過程之間的關(guān)系的一門學(xué)科。目前脂質(zhì)組學(xué)已經(jīng)被廣泛運(yùn)用于藥物研發(fā)、分子生理學(xué)、分子病理學(xué)、功能基因組學(xué)、營養(yǎng)學(xué)以及環(huán)境與健康等重要領(lǐng)域。



 

由于常規(guī)的脂質(zhì)組學(xué)大多僅僅使用lipidmaps、lipidsearch等公共理論數(shù)據(jù)庫進(jìn)行物質(zhì)定性,而僅依賴脂質(zhì)碎裂規(guī)則來定性不可避免的會(huì)帶來更高的假陽性,降低數(shù)據(jù)結(jié)果的可靠程度。

    

而保留時(shí)間作為化合物的特有屬性,可以作為一個(gè)多元的維度來輔助物質(zhì)定性。特別是在GC領(lǐng)域已經(jīng)有了非常廣泛的應(yīng)用。

    

阿趣代謝作為代謝組學(xué)領(lǐng)域的優(yōu)秀團(tuán)隊(duì)對(duì)脂質(zhì)組學(xué)物質(zhì)鑒定帶來了重大升級(jí),經(jīng)過長期的研究和驗(yàn)證,在脂質(zhì)鑒定中增加保留時(shí)間這一維度,實(shí)現(xiàn)經(jīng)典非靶脂質(zhì)組的全新升級(jí)。大家一起來看看吧~
 

02
產(chǎn)品升級(jí)


 

與傳統(tǒng)采用多種質(zhì)控體系來提高定性準(zhǔn)確度的策略不同,升級(jí)后的經(jīng)典脂質(zhì)組主要是在原來的脂質(zhì)組方法的基礎(chǔ)上,增加保留時(shí)間這一維度,降低錯(cuò)誤率,脂質(zhì)的定性結(jié)果更準(zhǔn)確可靠。

 

我們針對(duì)多種樣本類型進(jìn)行了驗(yàn)證。結(jié)合創(chuàng)新型的保留時(shí)間預(yù)測(cè)算法,對(duì)不同樣本類型的脂質(zhì)組數(shù)據(jù)重新進(jìn)行定性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),各樣本類型重現(xiàn)率均能達(dá)標(biāo)(70%以上),定性結(jié)果可靠。


同時(shí),在增加了保留時(shí)間預(yù)測(cè)算法之后,常見幾大類的脂質(zhì)的錯(cuò)誤率均有所下降。其中,針對(duì)小鼠腦組織樣本類型,LPE、PC、PE、PS、SM和TAG的錯(cuò)誤率均有一定的下降;而各樣本類型中PC的錯(cuò)誤率能夠穩(wěn)定得到降低。


 

03
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)


 

Biotree經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué)

 

  • 高分辨儀器平臺(tái):Q Exactive Focus(Thermo Fisher Scientific)

  • 數(shù)據(jù)庫:基于LipidBlast構(gòu)建包含甘油磷脂、鞘脂、固醇脂、甘油脂、脂肪酸、糖脂等在內(nèi)的52類脂質(zhì),22W+種脂質(zhì)

  • 內(nèi)標(biāo):2個(gè)同位素內(nèi)標(biāo)

  • 六大質(zhì)控體系:過程質(zhì)控、數(shù)據(jù)質(zhì)控

  • 專業(yè)的數(shù)據(jù)分析:專業(yè)數(shù)據(jù)處理和分析軟件,PCA、OPLS-DA、T-test等分析

  • 項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn):平均項(xiàng)目可檢出900+脂質(zhì)

  • 定性結(jié)果更準(zhǔn)確,適用性高:保留時(shí)間預(yù)測(cè)算法輔助定性



     

    BIOTREE擁有過硬的質(zhì)譜檢測(cè)技術(shù)和專業(yè)的服務(wù)平臺(tái)。從2012年到2020年,一直致力于質(zhì)譜研究。在經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)上積累了大量的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),我們致力于打造一流的技術(shù)服務(wù)團(tuán)隊(duì)。

發(fā)布者:上海百趣生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
聯(lián)系電話:021-61531195
E-mail:chengyichun@biotree.cn

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