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高通量單細胞轉錄組測序發(fā)展與展望

瀏覽次數(shù):1330 發(fā)布日期:2021-2-2  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
單細胞轉錄組測序技術這幾年的發(fā)展之快,運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術,也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中,上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納,在《生命科學》雜志上發(fā)表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發(fā)展與展望”綜述文章,希望能進一步提升科研工作者對該技術的認識和了解,以更好地將該技術發(fā)揚光大。
 

本綜述通過對高通量單細胞轉錄組檢測技術的發(fā)展進展,檢測技術的特點,數(shù)據(jù)分析方法等角度進行綜述,并對目前存在的問題及將來可能的發(fā)展方向進行了討論。

在第一部分,綜述對高通量單細胞轉錄組測序平臺研究進展進行了整理,這里包括單細胞轉錄組測序的基本實驗流程,技術特點,特別是現(xiàn)在商用比較廣泛的10X Genomics公司的微滴技術和DB的微孔技術進行了詳細描述與技術對比。
 


高通量單細胞轉錄組測序研究最重要的一個工作是對大數(shù)據(jù)的分析和數(shù)據(jù)挖掘,在第二部分,該綜述詳細介紹了單細胞測序數(shù)據(jù)的后續(xù)數(shù)據(jù)分析過程和常用分析方法。另外,針對單細胞轉錄組數(shù)據(jù)的特點,本文還重點闡述了細胞軌跡推演,細胞互作預測和功能富集幾種常見且具有代表性的單細胞轉錄組數(shù)據(jù)深入挖掘高級分析內容。



在第三部分,綜述重點對單細胞轉錄組測序中的常見技術問題:樣本類型選擇、多細胞率、捕獲效率、罕見亞群缺失問題進行了闡述,并根據(jù)最新的研究進展,提出了可能的解決方案。從這里,我們也可以看到,雖然每種技術方法有各種不完美的地方,但是,現(xiàn)在對單細胞技術的廣泛關注,也使得這些存在的問題在一步步解決。

在隨后一部分,本綜述對單細胞技術的未來發(fā)展進行了展望。單細胞轉錄組測序用于lncRNA、外泌體檢測,用于降低成本的多樣本標簽技術,空間轉錄組測序技術,三代測序用于單細胞轉錄組,單細胞多組學技術等進行了展望。我們相信,在接下來的幾年中,單細胞轉錄組研究會為科學研究帶來更多的成果和產(chǎn)出。

參考文獻:高通量單細胞轉錄組測序發(fā)展與展望. 生命科學, 2020, 32(12): 1280-1287.

發(fā)布者:上海生物芯片有限公司
聯(lián)系電話:400-100-2131
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