PCR (Polymerase Chain Reaction)，中文翻譯為聚合酶鏈式反應，是一種用于放大擴增特定的DNA片段的分子生物學技術(shù)，它可看作是生物體外的特殊DNA復制。 由1983年美國Mullis首先提出設想，1985年由其發(fā)明了聚合酶鏈反應，即簡易DNA擴增法，意味著PCR技術(shù)的真正誕生。到如今，PCR技術(shù)已廣泛應用于生命科學、醫(yī)學研究、遺傳工程、法醫(yī)學、考古學、人類學等領域。

PCR原理
  PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復制過程，其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構(gòu)成：①模板DNA的變性：模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后，雙鏈DNA解離，成為單鏈；②模板DNA與引物的退火（復性）：模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后，溫度降至55℃左右，引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合；③引物的延伸：DNA模板--引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶（如TaqDNA聚合酶）的作用下，以dNTP為反應原料，靶序列為模板，按堿基互補配對原則，合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈，重復此過程就可獲得更多的“半保留復制鏈”。

PCR引物設計基本原則
①引物長度：15-30bp，常用為20bp左右。
②引物堿基：G+C含量以40-60%為宜，G+C太少擴增效果不佳，G+C 過多易出現(xiàn)非特異條帶。
③兩個引物之間不應存在互補序列，尤其是避免3'端的互補重疊。
④引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%，引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列，否則易導致非特異性擴增。
⑤引物的5'端可以修飾。如附加限制酶位點，引入突變位點，用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標記，加入其它短序列，包括起始密碼子、終止密碼子等。

PCR反應特點
特異性強
簡便靈敏
純度要求低

常見問題與解答
1、Q: 不出現(xiàn)擴增條帶？
A: 在酶和引物質(zhì)量好時，不出現(xiàn)擴增帶，極有可能是標本的消化處理，模板核酸提取過程出了毛病。例如，模板中含有雜蛋白質(zhì)，在提取制備模板時丟失過多，或吸入酚。因而要配制有效而穩(wěn)定的消化處理液，其程序亦不宜隨意更改。
2、Q: 出現(xiàn)的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致，但其條帶更整齊，亮度更高（假陽性）。
A: 出現(xiàn)假陽性的原因有：①引物設計不合適：選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性，在進行PCR擴增時，擴增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。因此，需重新設計引物。②靶序列或擴增產(chǎn)物的交叉污染。這種假陽性可用以下方法解決：操作時應小心輕柔，防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或濺出離心管外。除酶及不能耐高溫的物質(zhì)外，所有試劑或器材均應高壓消毒。所用離心管及樣進槍頭等均應一次性使用。
3、Q: 出現(xiàn)非特異性擴增條帶？
A: 非特異性條帶的出現(xiàn)，其原因：一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg²⁺離子濃度過高、退火溫度過低，及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關。三是酶的質(zhì)和量，酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有：必要時重新設計引物。減低酶量或調(diào)換另一來源的酶。降低引物量，適當增加模板量，減少循環(huán)次數(shù)。
4、Q: 出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶？
A: 其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差，dNTP濃度過高，Mg²⁺濃度過高，退火溫度過低，循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有：①減少酶量，或調(diào)換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度，適當降低Mg2+濃度。③增加模板量，減少循環(huán)次數(shù)。