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銳博生物 Cell:LincRNA-EPS如何通過轉錄制動來發揮抑制炎癥作用

瀏覽次數:4010 發布日期:2017-2-17  來源:銳博生物

麻省大學醫學院的Katherine研究團隊于6月16號在Cell上發表了lincRNA-EPS能夠抑制免疫炎癥反應的研究成果,進一步證明lincRNA在免疫系統中的重要性。

研究背景

基因間長鏈非編碼RNA (Long intergenic noncoding RNAs, LincRNAs)是基因表達的重要調節者,雖然lincRNAs在免疫細胞中表達,但是他們在免疫上的功能并未得到廣泛的研究。而先天免疫系統作為抗菌感染的防御第一線,依賴著動態的轉錄調節改變,在模式識別受體 (germline-encoded pattern-recognition receptors) ,如Toll-like受體(TLRs),檢測到微生物入侵時會發揮其應有的作用。炎癥基因的表達在抗菌防御方面來說顯得極其關鍵,而信號依賴的轉錄因子的激活,轉錄共調節因子,染色質修飾因子協同控制抗菌防御的炎癥反應。

研究目的

探究lincRNA-EPS在細胞中對免疫反應的作用

思路與方法

 

研究結果

1. 巨噬細胞中的lincRNA-EPS水平隨著對微生物與炎癥觸發物的應答而動態調節,在暴露于微生物配體的巨噬細胞中lincRNA-EPS受到抑制。

2. lincRNA-EPS導致IRGs的時序調控特殊方式,且其基因刪除增強了巨噬細胞中IRGs的表達,經實驗驗證lincRNA-EPS的異位表達阻止巨噬細胞中IRGs表達,即lincRNA-EPS在巨噬細胞中扮演著炎癥反應抑制者的角色。


圖1 基因刪除增強了巨噬細胞中IRGs的表達

3.lincRNA-EPS在休眠的巨噬細胞中與核染色質相關聯,實驗證明lincRNA-EPS在轉錄水平上調控IRGs的表達,并調控核小體定位。


圖2 lincRNA-EPS在休眠的巨噬細胞中與核染色質相關聯


圖3 lincRNA-EPS在轉錄水平上調控IRGs的表達,并調控核小體定位。

4.hnRNPL是lincRNA-EPS的結合蛋白,其結合序列為位于30-531區域的CANACA基序,該結合基序是抑制IRGs與結合hnRNPL蛋白的關鍵。

5.由于lincRNA-EPS缺陷細胞在基礎條件與TLR4刺激條件下都表現出IRGs表達增加,故他們假設lincRNA-EPS抑制體內炎癥并通過實驗得到證實。


圖4 lincRNA-EPS抑制體內發炎


銳博小編:轉錄組測序可是長鏈非編碼RNA發現和表達豐度分析的“神器”,本文作者在本研究中多次通過轉錄組測序來進行分析lincRNA-EPS功能與作用機理,并取得非常不錯的效果。銳博生物提供全面高質量的轉錄組學測序服務、基于測序數據的標準和定制化的生物信息學分析服務。

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發布者:廣州市銳博生物科技有限公司
聯系電話:4006860075
E-mail:marketing@ribobio.com

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