對存活微生物實施快速、敏感和特異性檢測是許多微生物學研究和質控對照領域的基本需求。real-time PCR 等基于 DNA的擴增技術能夠提供所需的速度和特異性。活菌 PCR 是微生物學研究的新一代技術，它將細胞的存活信息與 PCR 類檢測法的速度和特異性整合在一起。

活菌 PCR 是一項創新型的技術，能夠分辨存活和死亡的微生物。QIAGEN 的活菌 PCR 系統中使用了 DNA 的嵌入試劑單疊氮丙啶（PMA）。PMA 是一類能夠在 DNA 水平上區分微生物存活與否的化學分子，當使用特定波長的激光激活 PMA 時，PMA 會嵌入 DNA 并與之共價結合。在后續的 PCR 反應中被修飾 DNA 的擴增將受到抑制，從而導致擴增信號降低。

PMA 無法透過完整的生物膜結構。這意味著來自存活微生物的 DNA 由于有完整膜結構包裹而不會受到 PMA 修飾，因此可以被 PCR 反應檢測出來。微生物死亡細胞的膜結構由于失去了其原有的保護功能，PMA 能夠進入細胞并修飾其中的 DNA。死亡微生物細胞中被修飾的 DNA 在PCR 反應時受到抑制，從而導致擴增信號降低。

PMA 帶有強正電荷，這意味著它無法穿透完整的存活細胞膜。它同時具有一個錨定基團，能夠在特定波長的光學激發下與 DNA 完成不可逆的結合反應。這一特性使得 PMA 能夠競爭超越其他 DNA 嵌入染料與核酸的結合，成為 QIAGEN 的 BLU-V® Viability 產品線的基礎組件。

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