棉鈴蟲（Helicoverpa armigera），是夜蛾科昆蟲的一種，寄主植物有20多科200余種，其中大部分為重要栽培作物，是棉花的主要害蟲之一。棉鈴蟲單核衣殼核多角體病毒（HaSNPV）是一種桿狀病毒,能專一性地感染棉鈴蟲，作為生物殺蟲劑已得到廣泛應(yīng)用。

近日澳大利亞昆士蘭大學(xué)的研究人員對棉鈴蟲免疫系統(tǒng)是如何應(yīng)答并抵御HaSNPV侵染的機制進(jìn)行研究，并將研究成果發(fā)表在Journal of Virology的10月刊上*。研究人員首先通過對感染HaSNPV的棉鈴蟲進(jìn)行小RNA深度測序（LC Sciences，聯(lián)川生物美國母公司提供技術(shù)服務(wù)），發(fā)現(xiàn)大量small read（約20個核苷酸）可比對至HaSNPV基因組，并且這些Read比對到病毒基因組熱點區(qū)的特定開放閱讀框（ORF）上，這些ORF大部分為結(jié)構(gòu)基因和輔助晚期基因。隨后，利用miRDeep在HaSNPV基因組上預(yù)測可做為pre-miRNA的潛在莖環(huán)結(jié)構(gòu)。通過分析小RNA序列與潛在莖環(huán)結(jié)構(gòu)的比對結(jié)果，Read count，負(fù)義鏈數(shù)量，雙鏈堿基配對數(shù)量以及其他參數(shù)，研究人員判定所有預(yù)測的莖環(huán)結(jié)構(gòu)都不符合pre-miRNA的特征。在排除這些小RNA是miRNA的可能性后，這些小RNA被認(rèn)定是由Dicer-2，昆蟲中參與RNAi應(yīng)答的主要酶，加工產(chǎn)生的病毒短干擾RNA（v-siRNA）。

 

上述研究表明，昆蟲中RNAi途徑在抗RNA病毒應(yīng)答過程中發(fā)揮著主要作用。應(yīng)答過程為剪切雙鏈RNA基因組或復(fù)制過程中產(chǎn)生的中間體成為v-siRNA，然后通過降解病毒轉(zhuǎn)錄本以達(dá)到抵御病毒侵染的目的。

 

*：Jayachandran B, Hussain M, Asgari S. (2012) RNA interference as a cellular defense mechanism against the DNA virus, baculovirus. J Virol [Epub ahead of print].

 

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