GEO相關服務:
1,芯片數據挖掘。根據芯片類型,計算表達譜,差異基因等
2,高通量測序數據挖掘。根據測序類型,計算表達譜,差異或者peak calling等
3,多組學數據聯合分析
4,GEO原始數據上傳/下載
TCGA相關服務:
1,特定癌癥的表達譜,差異分析
2,Cox回歸,生存分析
3,預后模型
4,免疫浸潤
轉錄組相關:
1,GSEA/GSVA分析
2,CNC共表達網絡分析
3,ceRNA網絡分析,包括LncRNA-miRNA-mRNA ceRNA網絡,circRNA-miRNA-mRNA ceRNA網絡等
4,WGCNA分析
5,GO,Pathway分析,常規物種和特殊物種
6,蛋白質-蛋白質相互作用分析
7,hub基因分析
8,circRNA同源分析
9,時序表達分析
10,Venn圖
11,PCA分析
小RNA相關:
1,miRNA靶基因預測
2,miRNA-靶基因網絡分析
3,miRNA二級結構分析
4,piRNA靶基因預測
測序服務:miRNA-seq
ChIP、MeDIP相關:
1,峰可視化
2,motif分析
3,circos圖
MeRIP/m6A相關:
1,m6A和RNA-seq聯合分析四象限圖
2,相關系數
3,peak venn圖
4,circos圖
5,motif分析
6,metaplot
eccDNA相關:
1,eccDNA長度分布
2,motif分析
3,染色體分布
4,不同基因組特征分布
其他聯合分析:
1,RNA-seq和MeRIP-seq聯合分析
2,miRNA-seq和circRNA-seq聯合分析
3,mRNA-seq和eccDNA-seq聯合分析
個性化作圖、分析相關:
1,提供論文例圖定制開發
2,提供數據,測試程序等bio-equip.com
公司致力于利用各種組學(基因組、轉錄組、表觀組、表觀遺傳組、蛋白組、代謝組等)數據和生物信息學數據庫、軟件工具、在線平臺等,幫助研究者了解數據,挖掘數據背后的生物醫學知識,發表高水平科研論文,推動生物醫學的發展。
我們開發的“微生信云平臺”幫助用戶0代碼在線繪制出版級科研圖片,0代碼分析實驗數據。平臺目前擁有超過12w注冊用戶,google學術引用2000多篇。
