分子動力學（Molecular Dynamics, MD）模擬（動力學模擬）是近年來飛速發展的一種分子模擬方法，它以經典力學、量子力學、統計力學為基礎，利用計算機數值求解分子體系運動方程的方法，模擬研究分子體系的結構與性質。作為繼實驗和理論兩種研究方法之后，研究分子體系結構與性質的第三種科學研究方法，分子動力學模擬已經被廣泛應用于化學化工、材料科學與工程、物理、生物醫藥等科學和技術領域，起到越來越重要的作用。該技術不僅可以得到原子的運動軌跡，還可以觀察到原子運動過程中各種微觀細節。它是對理論計算和實驗的有力補充。主要優點：動態的研究方法、豐富的分析手段、可與分子對接、藥效團等分子模擬方法無縫結合等。
       中大唯信分子動力學模擬報告中的示意圖舉例分子動力學模擬 | 唯信 Wecomput（研究某結構的構象轉變過程）

【分子動力學模擬的研究內容】

• 自組裝模擬
• 大分子與小分子相互作用（藥物與靶標相互作用）
• 大分子之間的相互作用（蛋白-蛋白相互作用）
• 溶劑與溶質相互作用
• 大分子、小分子三維結構的優化
• 結構與功能、性質的關系

【可選的分析項目】

• 分子構象采樣（聚類分析、優勢構象識別）
• 相互作用分析（氫鍵網絡、Contact-Map）
• 結合自由能計算（MM-PBSA、TI、FEP）
• 骨架波動分析（RMSD、RMSF）
• 熱點殘基分析（Alanine-scanning, Energy-decomposition）
• 構象轉變分析（PCA、Energy-landscape plotting）
• 理化性質分析（能量、體積、壓強、溫度、密度監測）

【服務特色與優勢】

中大唯信是一家專為生物制藥領域提供分子動力學模擬服務的專業信息科學整體解決方案公司，團隊成員均為來自海內外著名高校或科研機構的研究人員，在藥物和生物體系的分子動力學模擬方面擁有豐富的經驗。已經獨立或協助客戶完成了大量相關課題，通過實驗和計算相輔相承，很多成果都發表在生命醫藥領域的各類著名SCI期刊。我們的研究人員通常要求對生物實驗也有充分的了解，可以通過簡單的描述快速了解項目的情況，并視委托方需求，迅速建立一套可行的研究方案，省去大量文獻調研的時間。此外，我們與多個高校或研究機構有合作，對于一些復雜問題可以咨詢業內專家的意見與建議。全部計算完成之后，可以按照委托方的要求出具中英文分析報告，也可以協助英文學術論文或專利等的寫作，以及提供投稿建議等。

【服務流程】

客戶提出需求->初步可行性分析->中大唯信提供研究方案->雙方協商修訂細節->簽訂協議->開始服務->付款->提交結果->客戶反饋->后續跟進

Wecomput Technology（唯信計算®，北京中大唯信科技有限公司）致力于用計算技術驅動創新藥研發、造福人類健康。公司以藥物設計、計算服務、專業軟件開發為主要業務，目前已與數百家藥企、醫院、高校與科研院所建立了深度合作，發表了數百篇SCI論文，申請多項發明專利與軟件著作權。創始團隊由來自國際知名藥物設計軟件公司、頭部藥企、知名互聯網公司、985高校的專業人士構成，具備深厚的專業背景和豐富的新藥研發實踐經驗。