基于成像的空間原位單細胞技術(shù)由于然受到光譜重疊、熒光團可用性以及光學(xué)擁擠環(huán)境中信噪比的影響,RNA檢測往往面臨著顯著的靶標數(shù)限制。CosMx WTx (CosMxTM Human Whole Transcriptome Panel;~19000-plex RNA)技術(shù)突破通量限制,實現(xiàn)超高分辨率+空間原位+全轉(zhuǎn)錄組檢測,以超多重檢測能力、亞細胞級空間定位和單分子靈敏度,重新定義RNA分析的極限,為生命科學(xué)研究帶來革命性突破!
CosMx WTx已在包括極具挑戰(zhàn)性FFPE在內(nèi)的多種樣本類型中得到驗證,目前已正式開放預(yù)訂。
獨特的探針設(shè)計和化學(xué)結(jié)構(gòu),在FFPE樣本中實現(xiàn)更高的細胞和轉(zhuǎn)錄本檢出率
CosMx WTx檢測試劑盒探針原位雜交探針設(shè)計基本包含了全部人類蛋白編碼基因( 占HUGO所注釋的蛋白編碼基因的99.5%以上)。捕獲序列的選擇遵循了嚴謹?shù)牡O(shè)計過程,保證了探針針對靶標的特異性,同時在RNA分子高度片段化的FFPE組織中也能實現(xiàn)高檢測靈敏度。
穩(wěn)定高效的原位雜交循環(huán)成像化學(xué)原理
(1)可實現(xiàn)高信噪比(SNR)檢測,精準識別單個熒光信號點;
(2)通過紫外線(UV)可以快速、溫和地淬滅熒光信號;
(3) 在工業(yè)生產(chǎn)過程中嚴格控制,確保每個檢測轉(zhuǎn)錄本的原位成像具有相同的光斑大小和熒光強度。
高分辨率的大數(shù)據(jù)輸出
CosMx WTx利用先進的光學(xué)系統(tǒng)和低體積微流體技術(shù),能夠高效地實現(xiàn)對數(shù)百萬個細胞進行分析,獲得全面的空間信息。
自適應(yīng)解碼算法提高數(shù)據(jù)質(zhì)量
CosMx WTx采用了先進的自適應(yīng)解碼算法,通過動態(tài)調(diào)整最大限度地捕獲轉(zhuǎn)錄本和最小化非特異性信號,為轉(zhuǎn)錄本計數(shù)提供了更高的可信度,實現(xiàn)更精確的單細胞分析。
廣泛適用于多種組織類型
已證明可廣泛適用于各種組織類型,例如不同類型腫瘤組織、腦組織、皮膚等,同時兼容蠟塊、FFPE組織切片、新鮮冷凍樣本等多種樣本類型送樣。
高動態(tài)范圍和全面的轉(zhuǎn)錄本檢測
以下是官方驗證CosMx WTX在FFPE樣本中的檢測能力和性能表現(xiàn):對六種不同的人類組織類型(結(jié)腸、胰腺、海馬、皮膚、乳腺、腎臟)的5μm FFPE切片進行檢測,每個樣本(約1cm2檢測面積)能夠獲得30萬~60萬個具有空間背景的單細胞,六種組織類型檢測基因數(shù)在8,392-15,960之間,每個細胞檢測到約1,556個轉(zhuǎn)錄本(中位數(shù))。
官方數(shù)據(jù)展示
精準的細胞分割算法
CosMx SMI的細胞分割方法結(jié)合了細胞核、細胞體、細胞膜等多種高分辨率細胞形態(tài)成像信息和數(shù)據(jù)驅(qū)動的機器學(xué)習(xí)算法,從而獲得精準的單細胞邊界界定。
官方數(shù)據(jù)展示
CosMx WTx空間單細胞全轉(zhuǎn)錄檢測技術(shù)是空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域的一個重要里程碑,其建立在循環(huán)原位雜交化學(xué)的基礎(chǔ)上,通過原位成像實現(xiàn)了超高分辨率覆蓋全轉(zhuǎn)錄組檢測,解決了基于成像的單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)通量上的局限,支持研究人員全面地了解完整組織環(huán)境中的細胞及分子機制,從而為生物發(fā)現(xiàn)和治療干預(yù)提供新的見解。
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