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CosMx™ Human 6K Discovery Panel
單細胞+空間原位+6K基因

在單細胞空間原位對6000個基因的檢測分析，實現單細胞研究的空間組學躍遷，以深入的洞察力開啟前所未有的空間生物學之旅。

技術特點

您是否正在致力于開發繪制單細胞圖譜？您是否著眼于鑒定細胞狀態并探索其功能？您是否關注于細胞配體-受體相互作用以研究細胞通訊？您是否致力于解析組織微環境表型或進行生物標記物發現？如果是這樣，CosMx™ Human 6K Discovery Panel能讓您在單細胞水平上對幾乎整個生物學通路進行空間分析，所涵蓋的基因靶標經過了充分驗證，并具有簡單的樣本制備流程、直觀易用的儀器操作和可靠穩定的系統運行等特點優勢，全方位加速您的單細胞空間生物學研究。超多靶標的單細胞空間原位表達信息不僅可以實現精細的細胞分型，繪制單細胞空間圖譜，對于細胞配受體檢測、細胞通訊、細胞狀態、細胞微環境表型分析和生物標志物發現也提供了強大的挖掘潛能。

全面的通路覆蓋和穩定可靠的數據質量

● 超多檢測靶標：在單張載玻片上分析超過6000種RNA靶標，包含超過400對配體-受體，全面剖析幾乎所有生物學通路；

● 超高分辨率：真正意義的單細胞分辨率，甚至亞細胞分辨率；

● 行業領先的細胞分割算法：實現精確的單細胞邊界識別和界定，保證后續單細胞原位轉錄組分析的可信度；

● 支持靈活定制方案：可定制添加多達200個額外的RNA靶標；

● 高度可信的數據質量：設置多重陰性對照，增強您對數據質量的信心；

利用易用的交互式AtoMx™空間信息平臺 (SIP)開展數據分析和結果可視化。

應用領域

01 繪制單細胞空間圖譜

使用Allen Human M1 Atlas數據進行半監督細胞分型

02 揭示配體與受體的相互作用

發現不同類型細胞配體-受體的空間共定位、共表達

在肝癌FFPE樣本中發現不同類型細胞中配受體的空間共表達模式

03 發現稀有細胞，實現更精細的細胞分型

配體共定位識別人腦中的罕見細胞類型：Sst Chodl神經元

根據配體相關性矩陣構建的圖譜網絡，識別出具有長程投射的罕見皮層中間神經元。

對配體鄰域表達譜的相關矩陣進行無監督聚類，以識別共定位配體群。其中一個配體集群由SST、NPY和CORT這3種配體組成，它們的鄰域表達譜顯示出很強的相關性。這3種配體的共同表達確定了一種罕見的細胞類型：Sst Chodl神經元。

04 發現新的生物標志物 — Plex Matters!

使用CosMx™ 6K Discovery Panel 可以對差異表達進行更全面的分析，并極大程度提高發現生物標記物的潛力

如兩幅火山圖所示，與CosMx™ Human Universal Cell Characterization RNA Panel相比，CosMx™ Human 6K Discovery Panel能識別出更多具有統計學意義和生物學意義的腎癌相關基因。

單細胞空間原位6K公共數據集
CosMx Human Frontal Cortex FFPE Dataset

整個組織切片的空間細胞圖譜和細胞類型UMAP聚類

CosMx 6K數據集概覽

基于CosMx™ SMI單細胞空間原位分子成像系統，CosMx Human Frontal Cortex FFPE Dataset數據集對人類額葉皮層FFPE樣本中的6078個基因進行了單細胞分辨率的空間定位和原位表達分析*。該套數據集展示了CosMx™ SMI在單細胞空間領域領先的數據表現和性能。超過6000個基因檢測方案，能支持研究人員在單細胞分辨率的空間生物學研究中實現最全面的基因組覆蓋度，獲取全面深入的信息。

CosMx™ SMI 單細胞空間原位成像系統

CosMx™ SMI是一個突破性的單細胞空間原位成像平臺，結合了超高分辨率成像技術和多靶標檢測能力，能夠對組織切片中6000種RNA和64種蛋白質分子進行單細胞和亞細胞分辨率的原位成像，支持研究人員實現精準透徹的生物學解析。

眾所周知，FFPE樣本中的RNA和蛋白質通常質量較低，尤其是RNA往往降解嚴重，使得對于FFPE樣本的分子檢測分析極具挑戰性。CosMx™ SMI系統具有簡單的樣本制備流程和穩定的原位雜交化學原理，并能夠兼容多種組織類型（如新鮮冷凍（FF）、福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）、組織芯片（TMA）、類器官等），在單細胞分辨率上實現RNA和蛋白質在組織細胞原位精細的可視化展示和精準的定量分析。

超多靶標的單細胞空間原位表達信息不僅可以實現精細的細胞分型，繪制單細胞空間圖譜，詳細展示細胞鄰域和組織微環境，同時還支持細胞配受體檢測，在真實的組織空間背景下推進您對細胞間相互作用、細胞通訊和細胞狀態的深刻洞察。

CosMx™ SMI應用包括：

● 單細胞空間圖譜：發現不同細胞類型，繪制其組織空間定位；

● 差異表達分析：基于空間背景的單細胞轉錄組差異表達分析；

● 解析細胞狀態和細胞功能；

● 細胞鄰域分析：組織微環境的空間表型；

● 細胞通訊：配體-受體相互作用；

● 轉錄本和蛋白的亞細胞定位；

● 生物標志物的發現和驗證。

SBC先后搭建GeoMx® DSP和CosMx™ SMI兩大空間組學研究平臺，并與NanoString攜手共建DSP空間組學“卓越中心”，搭配10x Visium Cytassist以及LCM+timsTOF Pro 4D非靶向深度空間蛋白組平臺，打造空間生物學全鏈條創新多組學平臺及解決方案，助力科學發現。