中科新生命臨床縱向隊列固定RNA單細胞轉錄組新品嘗鮮

目前最火的組學技術是什么？單細胞轉錄組測序毫無疑問是其中之一。然而，和其它組學技術相比，單細胞測序對于樣本的要求又顯得無比苛刻——新鮮組織從離體到完成單細胞捕獲的時間一般不能超過48小時。另一方面，隨著精準醫療理念的不斷深入人心，臨床隊列研究也越來越多地從橫截面研究轉向前瞻性縱向隊列研究。

由此，引出了一個棘手的問題：如果研究者需要在采樣時間點后一個月觀察患者狀態來決定是否對該樣本進行單細胞測序，該如何操作呢？以往，我們通常只有兩種選擇：

·  先完成單細胞捕獲和建庫，這種選擇的代價是付出極高昂的成本；

·  冰凍組織，之后抽核進行單細胞核轉錄組測序，但這種選擇不太適合所有的研究方向（尤其是關注免疫細胞的研究）。

總之，到目前為止還沒有一個完美的方案能夠解決單細胞測序在臨床縱向隊列中應用的難題。

除了樣本保存困難之外，臨床縱向隊列的單細胞生信分析數據挖掘也是困擾很多臨床醫學研究者的另一大難題。單細胞測序本身的數據量已經是常規bulk組學的幾個數量級，一旦再加上縱向時間點維度，所產生數據的復雜程度讓需要研究者望而卻步。

針對以上這些痛點問題，中科新生命近期推出了“臨床縱向隊列固定RNA單細胞轉錄組整體解決方案”。該產品主要包含技術解決方案及生物信息分析解決方案兩部分。

#01

技術解決方案

技術部分，采用了 10x Genomics推出的一項新技術Chromium Fixed RNA Profiling Reagent Kits。這項技術最核心的特點是能夠鎖定并保存迅速變化的細胞狀態，解決單細胞測序必須使用新鮮樣本的痛點。從下圖可以看到，在加入RNA固定試劑后再冷凍保存，樣本中檢出的細胞比例基本沒有變化，由此可見RNA固定后的樣本穩定性。使用該技術，臨床研究者們可以將單細胞測序待測樣本保存起來，安心地去做病理切片觀察、WB、或是臨床隨訪來決定是否啟用該樣本。

圖1 PBMC加入RNA固定試劑后不同保存時間的單細胞轉錄組測序細胞檢出情況（數據來源：10x Genomics官網）

#02

生物信息分析解決方案

生物信息分析部分，中科新生命前期已推出重磅臨床研究方案——“縱向隊列多組學研究解決方案”，包括“研究方案設計-多維度組學分析-縱向隊列分析生信挖掘”的一站式服務，這些生物信息分析模塊不僅適用于單細胞轉錄組測序數據分析，更適用于單細胞組學與其它常規組學的多組學聯合分析（如蛋白質組、代謝組等），從而幫助研究者充分挖掘珍貴的臨床數據。

——  縱向隊列數據生信挖掘——

成熟、成套的四大模塊，及定制化深度挖掘

圖2 臨床縱向隊列多組學生物信息分析模塊

最后，優惠福利來了！

買1送3——產品預售期間，每簽一個臨床縱向隊列固定RNA單細胞轉錄組樣本，送3次組織解離及單細胞RNA固定。

買10送全套——簽單10個及以上固定RNA單細胞轉錄組樣本，送縱向隊列全套高級生信分析。
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