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BioNTech:毛細(xì)管電泳技術(shù)助力mRNA疫苗完整性評(píng)估

瀏覽次數(shù):9930 發(fā)布日期:2022-6-30  來源:安捷倫科技
 
mRNA作為一種新型的疫苗和藥物形式,為疾病的預(yù)防和治療帶來了新的希望。隨著mRNA疫苗被成功用于COVID-19的預(yù)防,國內(nèi)外針對(duì)各類傳染病、腫瘤、罕見病、自身免疫疾病等疾病的預(yù)防類疫苗或治療性藥物的研究也在如火如荼地進(jìn)行。在mRNA疫苗的研發(fā)及生產(chǎn)過程中,涉及對(duì)mRNA原料藥特性、純度、數(shù)量、物理狀態(tài)(完整性)和安全性等多方面的質(zhì)量評(píng)估,其中對(duì)mRNA完整性的評(píng)估是至關(guān)重要也是必須的步驟。

近日,中國國家藥品監(jiān)督管理局藥品審評(píng)中心發(fā)布的《新型冠狀病毒預(yù)防用mRNA疫苗藥學(xué)研究技術(shù)指導(dǎo)原則(試行)》中指出“應(yīng)選用可充分鑒別產(chǎn)品相關(guān)雜質(zhì)(截短mRNA、長RNA、雙鏈RNA等)且具有足夠靈敏度的檢測(cè)方法對(duì)原液、制劑等不同階段mRNA序列的完整性和純度予以確認(rèn)和控制,如毛細(xì)管電泳等。”

美國藥典(USP)關(guān)于“Analytical Procedures for mRNA Vaccine Quality” 的指導(dǎo)草案中也推薦使用毛細(xì)管凝膠電泳對(duì)mRNA完整性進(jìn)行質(zhì)控,其中推薦了Agilent System并詳述了其實(shí)驗(yàn)方法
 
 

問  USP指導(dǎo)草案中推薦的Agilent System毛細(xì)管電泳系統(tǒng)是啥?
 
Agilent Fragment Analyzer
 
Agilent Fragment Analyzer 自動(dòng)毛細(xì)管電泳系統(tǒng)采用12/48/96多道并行毛細(xì)管電泳的原理,一次可上樣三塊96孔板,可自動(dòng)連續(xù)運(yùn)行288個(gè)樣品。為您提供方便的、可靠的、一致的、高通量、低成本的mRNA質(zhì)量評(píng)估。
 
   
問  誰在用Agilent Fragment Analyzer做mRNA疫苗質(zhì)控?
 
我們?cè)谳x瑞/BioNTech公司接受美國CBS電臺(tái)關(guān)于“How the Pfizer-BioNTech COVID-19 vaccine was developed”的采訪視頻中看到了Agilent(原Advanced Analytical)Fragment Analyzer的身影。
 
BioNTech的研究者于2021年發(fā)表在Nature的文章中也提到采用Agilent Fragment Analyzer毛細(xì)管電泳系統(tǒng)進(jìn)行mRNA完整性評(píng)估。
 

 
   
國內(nèi)眾多不便透露名字的企業(yè)和質(zhì)檢部門也在其mRNA疫苗或藥物研發(fā)及質(zhì)量評(píng)價(jià)流程中使用Agilent Fragment Analyzer毛細(xì)管電泳系統(tǒng)進(jìn)行mRNA完整性的評(píng)估。
 
問  Agilent Fragment Analyzer在mRNA質(zhì)量評(píng)估中的表現(xiàn)如何?
 

1  準(zhǔn)確的、高重復(fù)性的片段大小結(jié)果
采用Agilent 5200 Fragment  Analyzer對(duì)濃度分別為1ng/μL、10ng/μL、50ng/μL、100ng/μL,理論長度分別約為1,800nt 和 6,039nt 的  IVT(In vitro transcription )mRNA進(jìn)行分析,結(jié)果顯示測(cè)得的平均片段長度分別為1,836nt和6,503 nt(見圖1和2),%CV和%Error均較低(見表1),結(jié)果表現(xiàn)出高度一致性和準(zhǔn)確性。
  
圖1 濃度分別為1ng/μL、10ng/μL、50ng/μL、100ng/μL,理論長度為1,800nt 的IVT mRNA電泳峰圖
 
圖2 濃度分別為1ng/μL、10ng/μL、50ng/μL、100ng/μL,理論長度為6,039nt 的IVT mRNA電泳峰圖
  
表1 濃度分別為1ng/μL、10ng/μL、50ng/μL、100ng/μL,理論長度分別為1,800nt和6,039nt 的IVT mRNA的平均片段大小、%CV、%Error統(tǒng)計(jì),n=3。

2  可檢測(cè)長達(dá)9,000nt甚至更長的mRNA
在Agilent 5200 Fragment  Analyzer上采用extended RNA method結(jié)合專門的Long RNA Ladder可實(shí)現(xiàn)對(duì)長達(dá)9,000nt甚至10,000nt的mRNA進(jìn)行準(zhǔn)確的片段大小的分析。
 
圖3 Long RNA Ladder電泳峰圖
 
圖4 濃度分別為1ng/μL、10ng/μL、50ng/μL、100ng/μL,理論長度為8,989nt的IVT mRNA電泳峰圖
 
表2 濃度分別為1ng/μL、10ng/μL、50ng/μL、100ng/μL,理論長度為8,989nt 的IVT mRNA的平均片段大小、%CV、%Error統(tǒng)計(jì),n=3。
  
圖5 濃度分別為1ng/μL、10ng/μL、50ng/μL、100ng/μL,長度為10,003nt的IVT mRNA電泳峰圖
 

表3 濃度分別為1ng/μL、10ng/μL、50ng/μL、100ng/μL,理論長度為10,003nt 的IVT mRNA的平均片段大小、%CV、%Error統(tǒng)計(jì),n=3。

3  準(zhǔn)確表征mRNA的降解程度
Agilent Fragment  Analyzer自帶ProSize 分析軟件,用戶可通過Smear分析批量計(jì)算符合要求的RNA片段的百分比或降解的RNA的百分比。
 
圖6 ProSize可計(jì)算目標(biāo)區(qū)間RNA含量百分比 

對(duì)長度為9000nt的IVT mRNA進(jìn)行不同時(shí)長的70℃孵育以獲得不同程度降解的mRNA樣品,通過Agilent 5200 Fragment Analyzer system進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果表明Fragment Analyzer可以準(zhǔn)確表征mRNA的降解程度。
 
峰圖和凝膠圖結(jié)果顯示,隨著加孵育時(shí)間的增加,9,000nt以上的片段逐漸減少,9,000nt以下的彌散條帶逐漸增多。
 
圖7 長度為9,000nt的IVT mRNA在70℃孵育0-16分鐘,其峰圖和凝膠圖
 
通過Prosize軟件進(jìn)行計(jì)算,結(jié)果顯示75-7,500nt以下的片段百分比逐漸增多,7,500-11,000nt以上的片段百分比逐漸減少,與預(yù)期結(jié)果一致。
 
表4  長度為9,000nt的IVT mRNA在70℃孵育0-16分鐘,75-7,500nt和7,500-11,000nt的片段百分比統(tǒng)計(jì)
 
4  可用于更多的mRNA疫苗評(píng)估環(huán)節(jié)
Agilent 5200 Fragment  Analyzer還可以進(jìn)行IVT mRNA純度的檢測(cè)如是否含有未完全轉(zhuǎn)錄的DNA模板、PolyA尾長度表征等。
 
圖8 含有DNA模板污染的mRNA
 
圖9 加了不同長度PolyA尾的mRNA凝膠圖
 
  
如需了解mRNA疫苗質(zhì)控的詳細(xì)流程,掃碼即可觀看mRNA疫苗質(zhì)控在線講座:
 
相關(guān)公司:安捷倫科技(中國)有限公司(Genomics)
聯(lián)系電話:800 820 3278,400 820 3278,010-64397888
E-mail:inquire-china_lsca@agilent.com


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