生物信息學-R語言繪圖與科技論文繪圖技術實操班通知

瀏覽次數：6415　發布日期：2016-8-30　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

關于舉辦“生物信息學最新技術”暨“生物信息繪圖技術與實踐”高級培訓班的通知

各有關單位:

生物信息實驗中的海量離散數據蘊含著各種顯著或潛在的規律和特征，這些規律或特征通常被淹沒在隨機信號和實驗誤差之中。將數據變為直觀的圖表，不僅可以形象化的展現數據中的這些規律，還能表現出數據之間存在著各種直接或間接的聯系（如包含、延伸、對照、線性等）。因此生物信息繪圖技術是在生物研究中非常重要的工具，能夠大幅提高研究者的科研效率，在實驗數據分析、科技論文寫作中不可或缺。生物信息繪圖軟件非常多，功能也各有不同，為了滿足廣大生物科技研究人員的迫切需要，北京海淀中科計算技術轉移中心（中科院計算所技術轉移中心）舉辦“生物信息學最新技術”暨“生物信息繪圖技術與實踐”高級培訓班，并由北京嘉誠永恒科技有限公司具體承辦。“智能信息處理技術”為人力資源與社會保障部中國科學院北京分院國家級專業技術人員繼續教育基地培訓點培訓項目，“生物信息”為智能信息處理技術系列培訓項目之一。具體事宜通知如下：

一、培訓目標及特點：

本培訓邀請的主講人均是有理論和實際研究經驗的人員。學員通過與專家直接交流，能夠分享到這些頂尖學術機構的研究經驗和實驗設計的思路。學員通過集中專題學習后能夠擴展思路，在研究技術方面領悟更多。

二、培訓對象：

大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫學、化學、農學、計算機科學、數學類專業的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員；科研單位從事生物、生命科學、微生物研究的相關人員；生物、醫藥、化學及相關企業的領導與技術骨干。

三、時間地點：2016年9月22日—9月26日北京

（時間安排：第1天報到，授課4天）

四、培訓內容：

一、科技論文繪圖概論	科技期刊對繪圖（figure）的具體要求和各種圖片格式及應用場景介紹；根據具體要求聯合應用Photoshop和Illustrator進行單張圖片的調整、整合和輸出；圖片細節的調整和美化，包括線條的快速調整、標尺的制作、文字的編排等；利用Mindmanager和億圖圖示專家等專業軟件進行 “思路圖”和科研項目流程圖的繪制。
二、R語言基礎	R語言簡介、功能及基本語法介紹
三、R語言功能及應用案例	R語言簡介、功能及基本語法介紹及實際操作 1）（散點圖--點線混合圖、并列散點圖、坐標對數化 2）條形圖-標準條形圖、推積條形圖、鄰接條形圖、Error Bar 形 3）圖文氏圖 4）餅圖--二維餅圖、三維餅圖 5）盒形圖--(箱線圖) 6）經驗分布圖 7）頻率直方圖 8）及熱圖（三種熱圖不同作圖方法）等的繪制
四、ggplot2的使用	掌握ggplot2繪圖相關命令，以及常見圖表（條形圖，折線圖，散點圖，直方圖以及密度圖等。添加注釋，分頁以及配色，坐標軸調整）
五、R在統計學中的應用	使用R做一些常用的統計分析。假設檢驗；回歸分析、方差分析；主成分分析、聚類分析等等（以生物、醫學和生態相關內容為例）
六、使用R語言進行生物信息學相關的分析	使用R語言相關的包對轉錄組等組學的高通量測序數據進行差異表達、富集分析等。
六、使用R語言進行生物信息學相關的分析	生物信息學專業圖KEGG、GO等的繪制方法與運用R語言進行實現
七、進化分析及作圖	基本進化樹構建方法（MEGA）,模型評估（MEGA），進化樹注釋（Evolview）
八、科技論文繪圖及修圖基礎	科技論文圖表要求；繪圖基礎知識、圖文件類型、來源與繪制方法介紹；常規繪圖與實現方法及軟件學習（powerpoint、visio、adobe illustrator等）
九、生物信息學專業常用工具及繪圖方法	運用生物信息常用的工具進行專業繪圖及格式轉換；學BioEdit、WeGO等常用生物學專業軟件的圖表及格式轉換
十、數據分析繪圖工具origin的使用	使用origin軟件進行圖形繪制、編輯以及曲線擬合等數據分析操作
十一、基因組可視化軟件circos的使用	使用circos繪制基因組圈圖