羅氏454測序應(yīng)用于花生種子敗育研究
454測序應(yīng)用于花生種子敗育研究
花生為豆科作物，是我國優(yōu)質(zhì)食用油主要油料品種之一，又名“落花生”或“長生果”，在全國各地均有種植，主要分布于遼寧、山東、河北、河南、江蘇、福建、廣東、廣西、貴州、四川等地區(qū)。在花生種子的生長發(fā)育過程中，胚栓插入土壤，膨壓將種皮推開后露出胚軸是一個重要過程，因此，胚栓入土失敗、胚軸的膨壓都有可能導致花生種子收益的損失。
近期，國內(nèi)學者們使用454測序平臺對花生種子的轉(zhuǎn)錄組進行了研究1，通過對地面上與地下的種子轉(zhuǎn)錄組cDNA文庫進行測序與拼接，獲得了近30,000條contig序列。在與已知數(shù)據(jù)庫及其他模式植物的轉(zhuǎn)錄組進行了注釋、功能上和代謝通路上的比較之后，發(fā)現(xiàn)光合作用通路在地面上的種子里有顯著富集，并找到一些與在地面上的種子敗育的潛在基因。
1. Chen, X., Zhu, W., Azam, S., Li, H., Zhu, F., Li, H., Hong, Y., Liu, H., Zhang, E., Wu, H., Yu, S., Zhou, G., Li, S., Zhong, N., Wen, S., Li, X., Knapp, S. J., Ozias-Akins, P., Varshney, R. K. and Liang, X. (2012), Deep sequencing analysis of the transcriptomes of peanut aerial and subterranean young pods identifies candidate genes related to early embryo abortion. Plant Biotechnology Journal. doi: 10.1111/pbi.12018
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