羅氏GS FLX+系統(tǒng)完成西班牙耐藥菌基因組測(cè)定
羅氏GS FLX+系統(tǒng)完成西班牙耐藥菌基因組測(cè)定
一個(gè)西班牙醫(yī)院近期發(fā)生Klebsiella pneunomiae細(xì)菌的暴發(fā)事件，研究人員分離了三個(gè)具有耐藥性的Klebsiella pneunomiae菌株，并利用羅氏454 GS FLX+系統(tǒng)獲得了其基因組序列，這些數(shù)據(jù)補(bǔ)充了該細(xì)菌屬的少量已知基因組信息，為其相關(guān)的耐藥性研究、基因組進(jìn)化研究提供了新的依據(jù)，同時(shí)為該細(xì)菌在此次醫(yī)院內(nèi)爆發(fā)事件提供新線(xiàn)索。Klebsiella pneunomiae常見(jiàn)于人類(lèi)口腔以及胃腸道內(nèi)，大多數(shù)情況下并不會(huì)引發(fā)疾病。但是其基因的某些突變會(huì)引起多種類(lèi)型的感染，同時(shí)這一細(xì)菌也被發(fā)現(xiàn)具有很強(qiáng)的獲得耐藥性突變的能力。該西班牙醫(yī)院的微生物部門(mén)獲得的三個(gè)Klebsiella pneunomiae菌株在GS FLX+平臺(tái)上完成測(cè)序后用儀器自帶的GS De Novo拼接軟件進(jìn)行基因組拼接，并進(jìn)行基因功能注釋?zhuān)Y(jié)果發(fā)現(xiàn)這些細(xì)菌出現(xiàn)了很多耐藥性方面的基因組進(jìn)化，使得醫(yī)院內(nèi)常用的許多抗生素對(duì)其失效。
通過(guò)這幾個(gè)菌株基因組的比較研究，為Klebsiella pneumoniae細(xì)菌的抗藥性研究提供了大量信息，也為在全球范圍內(nèi)減少抗藥性細(xì)菌出現(xiàn)的努力提供幫助。通過(guò)與其他細(xì)菌基因組的比較，可以進(jìn)一步了解微生物如何從對(duì)人類(lèi)無(wú)害變成具有致病威脅的菌株。
現(xiàn)在的微生物醫(yī)學(xué)研究正隨著測(cè)序技術(shù)的不斷更新發(fā)展向新的方向，快速定性、定量研究微生物是目前的一大趨勢(shì)，而454的GS FLX+以及GS Junior系統(tǒng)為微生物檢測(cè)、基因組測(cè)序拼接、比較基因組研究提供了強(qiáng)大的支持。
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