羅氏旗下454生命科學推出GS FLX Titanium系列試劑有效取代傳統的Sanger測序
羅氏旗下454生命科學公司宣布推出全新的GS FLX Titanium系列試劑和軟件，它們將改變生命科學行業。利用新的試劑，升級的Q20單個序列讀長達到400個堿基對（即第400個堿基的準確率也高達99%，前面的堿基準確率更高）；通量提高5倍，達到每輪運行能獲得4-6億個堿基對序列。產品性能提升到新高度，進一步鞏固了454生命科學公司在測序領域作為金標準的地位，在大多數應用中有效取代了傳統的Sanger測序法。
北美多個主流基因組研究中心增加該儀器的配置數量正是響應儀器性能提升的結果。貝勒醫學院是第一個安裝了10臺Genome Sequencer FLX儀器的機構，圣路易斯的華盛頓大學緊隨其后也立刻將FLX增加至8臺。麻省理工大學和哈佛大學合作的Broad研究院目前的儀器數量是10臺，聯合基因組研究院（Joint Genome Institute）也增至8臺FLX。
首批GS FLX Titanium系列試劑盒在今年早期運送至這些基因組中心以進行測試和評估。針對這些試劑和軟件表現的反饋意見都非常滿意,充分肯定了新系統的強大實力。實際上，幾個主要的基因組中心已經將GS FLX Titanium試劑運用于生產中。貝勒醫學院人類基因組測序中心的主管Richard Gibbs教授表示：“我們很高興能第一個優先使用GS FLX Titanium試劑，也非常滿意----新試劑的性能與454承諾的一樣好。新的試劑有效取代了Sanger測序，因此我們正將其應用到我們中心10臺GS FLX儀器上。”
麻省理工大學和哈佛大學聯合的Broad研究院的基因組生物計劃也是新試劑的早期用戶之一。該計劃的聯合主管Chad Nusbaum博士如此評價：“我們對新的GS FLXTitanium試劑系列的潛能非常樂觀，它能降低費用并提高測序質量。這個系統將有助于我們擴展研究范圍，實施以前覺得成本過于昂貴的項目。我們正在開發新方法來充分利用這個全新的長達400個堿基對的序列讀長能力，尤其是用于大型基因組的重新拼接。”
“我們用長的GS FLX Titanium序列讀長能力來對果蠅進行拼接，效果也非常好。利用454生命科學獨特的3K和20K配對末端讀序法，我們的N50 contig長度達到30-50kb，N50 scaffold的大小也超過3 Mb, 基因組的序列覆蓋度為12倍。”貝勒醫學院人類基因組測序中心的助理教授Stephen Richards博士表示, “與對照的果蠅基因組相比，這個結果非常好，說明GS FLX Titanium系列讀長至少相當于Sanger讀長的8倍，
而速度卻快得多，費用也少了一個數量級。”
Broad研究院測序部門的主管Rob Nicol博士補充道，“除了長達400bp的序列讀長和更高的測序讀長密度，新Titanium系列的改進有助于開發更高效、更高通量的工作流程，以應用于大規模測序工作中----例如人類微生物組計劃（HMP）中的微生物全基因組測序。GS FLX Titanium系列的高效步驟讓我們簡化了工作流程，大大縮短了從樣品到數據再到結果的時間。”
為GS FLX Titanium系列試劑的推出作準備，更多的客戶應邀參與了早期試用計劃。克萊格凡特研究院（J. Craig Venter Institute, JCVI）核心技術開發與服務的副總裁Yu-Hui Rogers博士表示，“我們用GS FLX Titanium系列試劑進行的初期驗證結果是非常令人鼓舞。一旦這些試劑推出，序列讀長和產能的提升將促使我們立即將新產品投入使用。新的試劑，以及從不同大小的插入片段文庫中獲得配對末端序列讀長的能力，將大大提升454系統在JCVI幾個重要測序應用中的作用，包括人類重測序和代謝基因組測序。”
454生命科學的CEO兼總裁Chris McLeod表示：“我們很高興能為迅速擴大的客戶群提供GS FLX Titanium系列試劑。GS FLX系統正迅速成為DNA測序的金標準，它與傳統的Sanger測序和許多所謂的微讀長技術相比，性能、準確性、價格的優勢顯而易見。”
無需對儀器的硬件做任何改動，僅僅改進試劑和軟件，就能實現技術性能提升。因此，目前使用GS FLX儀器的客戶不需要任何昂貴的儀器升級，即可利用和享受到這些改進。454生命科學研發部的副總裁Michael Egholm認為：“我們很自豪能為科學家提供這樣卓越的性能升級。聯合基因組研究院現在單次運行就能得到超過6.5億個堿基。我們的平臺能讓科學家迅速獲得有意義的結果，這一點從頂級學術期刊發表文章的驚人比例中也能看出。新的GS FLX Titanium系列試劑無以倫比的性能提升已經被市場認可，而毛細管測序儀正慢慢地被淘汰，客戶也逐漸轉向454測序平臺。”
北美多個主流基因組研究中心增加該儀器的配置數量正是響應儀器性能提升的結果。貝勒醫學院是第一個安裝了10臺Genome Sequencer FLX儀器的機構，圣路易斯的華盛頓大學緊隨其后也立刻將FLX增加至8臺。麻省理工大學和哈佛大學合作的Broad研究院目前的儀器數量是10臺，聯合基因組研究院（Joint Genome Institute）也增至8臺FLX。
首批GS FLX Titanium系列試劑盒在今年早期運送至這些基因組中心以進行測試和評估。針對這些試劑和軟件表現的反饋意見都非常滿意,充分肯定了新系統的強大實力。實際上，幾個主要的基因組中心已經將GS FLX Titanium試劑運用于生產中。貝勒醫學院人類基因組測序中心的主管Richard Gibbs教授表示：“我們很高興能第一個優先使用GS FLX Titanium試劑，也非常滿意----新試劑的性能與454承諾的一樣好。新的試劑有效取代了Sanger測序，因此我們正將其應用到我們中心10臺GS FLX儀器上。”
麻省理工大學和哈佛大學聯合的Broad研究院的基因組生物計劃也是新試劑的早期用戶之一。該計劃的聯合主管Chad Nusbaum博士如此評價：“我們對新的GS FLXTitanium試劑系列的潛能非常樂觀，它能降低費用并提高測序質量。這個系統將有助于我們擴展研究范圍，實施以前覺得成本過于昂貴的項目。我們正在開發新方法來充分利用這個全新的長達400個堿基對的序列讀長能力，尤其是用于大型基因組的重新拼接。”
“我們用長的GS FLX Titanium序列讀長能力來對果蠅進行拼接，效果也非常好。利用454生命科學獨特的3K和20K配對末端讀序法，我們的N50 contig長度達到30-50kb，N50 scaffold的大小也超過3 Mb, 基因組的序列覆蓋度為12倍。”貝勒醫學院人類基因組測序中心的助理教授Stephen Richards博士表示, “與對照的果蠅基因組相比，這個結果非常好，說明GS FLX Titanium系列讀長至少相當于Sanger讀長的8倍，
而速度卻快得多，費用也少了一個數量級。”
Broad研究院測序部門的主管Rob Nicol博士補充道，“除了長達400bp的序列讀長和更高的測序讀長密度，新Titanium系列的改進有助于開發更高效、更高通量的工作流程，以應用于大規模測序工作中----例如人類微生物組計劃（HMP）中的微生物全基因組測序。GS FLX Titanium系列的高效步驟讓我們簡化了工作流程，大大縮短了從樣品到數據再到結果的時間。”
為GS FLX Titanium系列試劑的推出作準備，更多的客戶應邀參與了早期試用計劃。克萊格凡特研究院（J. Craig Venter Institute, JCVI）核心技術開發與服務的副總裁Yu-Hui Rogers博士表示，“我們用GS FLX Titanium系列試劑進行的初期驗證結果是非常令人鼓舞。一旦這些試劑推出，序列讀長和產能的提升將促使我們立即將新產品投入使用。新的試劑，以及從不同大小的插入片段文庫中獲得配對末端序列讀長的能力，將大大提升454系統在JCVI幾個重要測序應用中的作用，包括人類重測序和代謝基因組測序。”
454生命科學的CEO兼總裁Chris McLeod表示：“我們很高興能為迅速擴大的客戶群提供GS FLX Titanium系列試劑。GS FLX系統正迅速成為DNA測序的金標準，它與傳統的Sanger測序和許多所謂的微讀長技術相比，性能、準確性、價格的優勢顯而易見。”
無需對儀器的硬件做任何改動，僅僅改進試劑和軟件，就能實現技術性能提升。因此，目前使用GS FLX儀器的客戶不需要任何昂貴的儀器升級，即可利用和享受到這些改進。454生命科學研發部的副總裁Michael Egholm認為：“我們很自豪能為科學家提供這樣卓越的性能升級。聯合基因組研究院現在單次運行就能得到超過6.5億個堿基。我們的平臺能讓科學家迅速獲得有意義的結果，這一點從頂級學術期刊發表文章的驚人比例中也能看出。新的GS FLX Titanium系列試劑無以倫比的性能提升已經被市場認可，而毛細管測序儀正慢慢地被淘汰，客戶也逐漸轉向454測序平臺。”
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