美國應用生物系統公司推出人全基因組范圍的成套SNP基因分型和基因表達定量分析試劑盒
瀏覽次數:6354 發布日期:2002-7-20
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美國加州2002年7月10日消息,美國應用生物系統公司今天宣布正式推出基于人類基因組信息的最完整的包括生物信息的全套人類基因組分析試劑,這是全球第一個基于人類基因組信息的商業化成套試劑產品線。 她的基因信息來源包含了人類基因組的公共數據庫和Celera公司的商業化數據庫。Assays-on-Demand基因組分析產品的數據庫來源包括:Celera基因組公司、國際SNP合作組織(TSC)、美國國家生物信息中心(NCBI)和日本國家SNP數據庫(JSNP)。
Assays-on-Demand基因組分析產品系列中的每一個分析試劑盒均經過活性測試,保證拿來就可以使用。她也是美國Applera公司2001年7月提出的新一輪人類基因組再測序研究項目的第一個商業化產品。 本次公布的試劑盒包括77,000個SNP位點基因分型試劑盒和4400個基因表達定量分析試劑盒,全部采用美國應用生物系統公司強大的生物信息學軟件和嚴格的流程進行設計。 每一個基因或SNP位點其靶基因序列均經過嚴格挑選和質量控制流程,以保證分析的高特異性和結果的優化。在以后的幾個月內,公司還將陸續推出更多的SNP基因分型和基因表達定量分析試劑盒,終極目標是提供覆蓋人類全基因組的SNP分析試劑盒和針對人類所有基因包括每一個基因的不同剪接子在內的定量表達分析試劑盒。
“通過整合人類基因組計劃的人類基因序列數據和2001年7月啟動的Applera公司人基因組再測序項目的序列信息,美國應用生物系統公司的知識產品正在為廣大科學家提供高信息含量的產品和技術服務,這些產品將使科學家的工作方式產生革命性的變化”,美國應用生物系統公司總裁Michael W. Hunkapiller說:“美國應用生物系統公司提供的Assay on Demand基因組分析系列產品將大大加速科學發現的步伐,使科學家們能夠在幾天或幾個星期內達到他們的研究目標,而不是數月或數年。這些成套的試劑盒也是實現個體化用藥的重要工具,將使臨床藥物治療可以針對每一個病人的個體差異”
全球多家第一流的大學研究所和生物技術公司參與了自2002年春季開始的Assay on Demand商業化計劃,德國基爾的Christian-Albrechts大學就是其中之一。 該大學的Stefan Schreiber教授說:“我們使用這套試劑盒進行系統性疾病相關研究,我們已經有效地確定了炎癥性結腸炎、良性淋巴肉芽腫,牛皮癬和牙周潰壞病相關的基因點突變。有了這些現成的成套SNP分析試劑盒,我們可以在幾個月內完成超過150萬個SNP分析的結果。再也不用象過去那樣,花好幾個月的時間分析整理基因組數據,設計、測試以及優化實驗。
Assay on Demand基因表達定量分析試劑盒
業已商業化的4400種定量基因表達分析試劑盒可以用于藥靶基因的鑒定、疾病表征,疾病分類,生化通路解析,藥物代謝,基因功能研究以及驗證用基因芯片技術研究人類疾病與藥物開發研究中得到的相關數據。第一套單反應管優化的Assays-on-Demand 基因定量分析試劑盒將包括美國國家生物信息中心(NCBI)人類轉錄基因標準數據庫中業已研究確定的超過15,000 種人類基因。用戶可以通過基因名稱,基因代碼,RefSeq or GenBank 中的數字代碼,基因功能分類和其他的標志符來挑選基因表達分析試劑盒。公司將會推出更多的基因表達分析試劑盒。更多的信息可在www.appliedbiosystems.com上查詢。
Assay on Demand SNP基因分型試劑盒
77000個SNP分析試劑盒每一個均經過活性測試因此可以直接使用,可以采用候選基因相關性、候選基因區域相關性、連鎖分析和連鎖不平衡研究進行疾病研究。每個SNP基因分型試劑均包含已分析過的兩大人群共90個個體的DNA樣本的SNP分型結果。這一信息可以用于驗證每一試劑盒的功效,決定各位點等位基因的頻率,這一點對于致病基因的定位非常重要。 客戶可通過NCBI基因或者單核苷酸多態性的參考代碼、基因名稱/記號/家族、各SNP在基因組中的位置、與STR標記位點的相關性、單核苷酸多態性類型和等位基因頻度等來選擇相應的SNP分析試劑盒。這些SNP分型試劑盒組成了一個高分辨并且以功能基因為中心的定位標記圖譜,將疾病研究,侯選藥物選擇和藥物療效研究關聯研究的有利工具。
單一堿基序列多態性(SNPs)的發生頻率為每100-300個堿基存在一個SNP位點(包括編碼區和非編碼區), SNPs是人類DNA序列變異的主要表現形式。. 盡管SNPs的研究工作仍在進行中, 但它對于藥物發現、臨床藥物試驗、生物醫藥研究以及臨床診斷應用中極具價值,前景無限。 在未來的幾個月內,會有更多的經過驗證的SNPs基因分型試劑盒發布。ABI公司設計在每一個人類基因上會有3個以上的SNP分析試劑盒并且在人基因組上每隔10kb將會有一個SNP分析試劑盒。更多的信息可檢索www.allsnps.com。
產品組成
每一個基因組分析試劑盒均為ABI Prism 7900HT,7700和7000熒光定量PCR儀優化。這些現成的分析試劑盒可以為客戶提供高精確性高重現性的數據,并且使研究者能更快、更簡便且更經濟地掃描更多的靶目標。
美國應用生物系統公司知識產品業務
2002年4月22日,美國應用生物系統公司成為賽來拉公司在線發現平臺的唯一發行者。此外,美國應用生物系統公司知識產品業務還整合了其它基因組數據庫的數據。知識產品業務通過提供信息量豐富的產品和優質的服務,幫助客戶改進研究試驗流程,為生命科學界客戶創造更多的價值。除了提供成套分析試劑盒以外,知識產品業務還提供幫助客戶設計引物探針服務(Assays-by-design),由客戶提供靶序列,ABI公司使用公司獨有的軟件為客戶的特定序列設計以及合成適宜的引物和探針。
詳盡的網上訂貨電子商務系統
成套分析試劑盒可通過ABI公司的網上商店進行直接訂購:http://store.appliedbiosystems.com/. 與賽來拉公司共同合作開發的網上訂購平臺提供了非常有效的檢索功能,方便研究者快速找到與他們的研究相關的分析試劑盒。 檢索選項包括:關鍵字、染色體位置、分子功能以及基因標識符批量檢索(可同時檢索多個靶序列)。 客戶可獲得靶序列在賽來拉數據庫、美國國家生物信息中心數據庫的ID信息以及試劑ID的信息,還有其它相關的生物學信息,并且檢索均是免費的。所有試劑盒都配有一個2維的條形碼作為識別根據,試劑盒可以成套訂購也可單個訂購。一旦有新的試劑盒面市,都會添加到網上商店里。
在網站的“About Us”欄位里,點擊“Press Kit”,即可找到成套分析試劑盒的產品單頁和動態介紹。動態介紹也可從http://www.newstream.com/下載。