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204 次 使用MANTIS，通過Smart-seq3生成高質量的單細胞RNA-seq數據 2025-6-20
單細胞RNA測序（scRNA-seq）是一項突破性技術，極大地提高了研究生物系統的分辨率。現在可以將復雜的組織分解成它們各自的細胞類型，并了解它們的基因表達模式。此外，現在不僅可以表征細胞群之
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226 次 使用桌面微流體技術實現低輸入RNA-Seq樣品制備的自動化和小型化 2025-6-18
引言：低輸入RNA-Seq工作流程的試劑和反應體積的小型化和縮小，使研究人員能夠在低樣本輸入和增加樣本數 量的情況下工作。隨著反應體積的減少，試劑體積的準確傳遞成為保持數據質量和技術重復性
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679 次 WGBS揭示AtSAMS通過DNA甲基化植物花器官發育的表觀遺傳機制 2025-3-27
花器官是植物繁殖的關鍵結構，其發育受到嚴格的遺傳調控。ABC模型是解釋花器官發育的經典理論，其中A、B、C、E功能基因分別調控萼片、花瓣、雄蕊和雌蕊的形成。然而，這些基因的表達調控機制尚未
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725 次 Cell文獻：轉座子外顯化構成了一個受進化選擇的功能蛋白質亞型儲庫 2025-3-24
轉座子（Transposable Elements，TEs），又稱轉座元件，指在基因組中能夠移動或復制，并可以整合到基因組新位點的一段DNA序列。可變剪接（Alternative Splicing，AS），又稱選擇性剪接，是指從一
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521 次 cfWGBS揭示與年齡和肌萎縮側索硬化相關cfDNA甲基化變化及組織 2025-2-27
游離細胞DNA (Cell-free DNA，cfDNA)是血漿中游離的DNA片段，通常來源于正常細胞更新或病理狀態下的細胞死亡。cfDNA已被廣泛應用于癌癥早期檢測、胎兒遺傳病診斷、器官移植評估等領域。然而，cf
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693 次 時空組學研究進展（二)：單細胞RNA測序數據的分析方法 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0scRNA-seq 的原始數據格式和目前大多數scRNA-seq 分析過程都基于 FASTQ 文件（或壓縮格式 fq.gz）。Illumina 平臺測序數據默認生成 BCL 格式文件
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1126 次 時空組學研究進展（一）：單細胞RNA測序的流程與技術 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0單細胞測序概述單細胞測序（Single-cell RNA sequencing; scRNA-seq）是一種開創性的單細胞測序技術，現在已得到廣泛普及，并涵蓋了多種方法。盡
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1110 次 DAP-seq助力揭示番茄抗酸鋁分子調控新機制 2024-10-23
2024年10月2日，云南農業大學園林園藝學院營養逆境與品質改良楊建立/范偉團隊在Horticulture Research期刊(IF=7.6)上在線發表題為“SlSTOP1-regulated SlHAK5 expression confers Al toler
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1004 次 Sfrp1抑制肺成纖維細胞向損傷誘導的肌成纖維細胞轉變期間的侵襲 2024-10-15
期刊：European Respiratory Journal影響因子：16.6主要技術：scRNA-seq；空間轉錄組；成纖維細胞導語組織纖維化是大多數主要慢性疾病中最大的未解決的臨床問題之一，產生細胞外基質（ECM）的肌
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973 次 植物組學時代的DNA甲基化研究在群體表觀遺傳學中的應用 2024-8-20
DNA甲基化在許多生物過程中發揮著重要作用。得益于數十年來對DNA甲基化突變體的研究，如今對DNA甲基化的建立和維持機制有了很好的理解，尤其在擬南芥（Arabidopsis thaliana）的Col-0品系中的研
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1099 次 空間轉錄組學在揭示獨特和保守的腫瘤核心和邊緣結構中的應用 2024-6-12
期刊：Nature Communications影響因子：16.6主要技術：ScRNA-seq、ST導語腫瘤微環境的空間組織對生物學和治療反應有著深遠的影響。對hpv陰性口腔鱗狀細胞癌(OSCC)進行了單細胞和空間轉錄組學分析
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1000 次 DAP-seq與RNA-seq聯合分析助力揭示AvERF73參與調控獼猴桃的耐澇性 2024-4-24
澇害（Waterlogging）是長期陰雨或暴雨后，由于地表積水，地面徑流不能及時排除，積水深度過大，時間過長，造成作物根部氧氣不足，并產生乙醇等有毒有害物質，從而影響作物生長，甚至造成作物死
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857 次 RNA-seq技術探究從牛膝中分離得到的果膠多糖被人體腸道擬桿菌代謝 2023-9-25
期刊：Int J Biol Macromol影響因子：8.2伯豪技術服務：RNA-seq導語牛膝是治療骨質疏松癥的著名中藥。多糖是形成腸道微生物群的主要因素，是雙棱草的主要成分。然而，雙歧桿菌多糖對人體腸道菌群
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974 次 scRNA-seq在彌漫性大B細胞淋巴瘤的單細胞轉錄組圖譜繪制中的應用 2023-8-2
期刊：Cell Reports影響因子：8.8導語彌漫性大B細胞淋巴瘤（DLBCL）是最常見但侵襲性最強的B細胞淋巴瘤之一，大約40%的患者仍然無法治愈。本研究使用單細胞測序（scRNA-seq）技術成功繪制了彌漫
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1088 次 RNA-seq等技術應用與探究結直腸癌遠端轉移起源于殘留的EMP1+細胞 2023-6-16
期刊：Nature影響因子：69.504導語大約30-40%的接受了原發性腫瘤根治性切除術的結直腸癌（colorectal cancer CRC）患者將在幾年后發生轉移。重要臟器的轉移及術后復發仍是主要的致死原因。然而，
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875 次 全基因組DNA甲基化和小RNA分析揭示甘藍型油菜種子的基因組不對稱性 2023-6-9
多倍體是被子植物基因組進化中的一種持續現象，有助于現存開花植物的多樣性。甘藍型油菜（Brassica napus）是世界上最重要的被子植物油料作物品種之一，起源于Brassica rapa（An）和Brassica ol
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752 次 小檗堿通過介導m6A mRNA甲基化調控斑馬魚肝細胞氧化應激 2023-6-6
中藥小檗堿（Berberine，BBR，化學式C20H18NO4）是從幾種藥用植物中分離出的一種異喹啉季生物堿，包括小檗（Berberis aristata）和黃連（Coptis chinensis）。小檗堿可改善脂質代謝紊亂誘導的細
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1139 次 全基因組ChIP-seq分析揭示細菌轉錄因子PhoB的基因內結合位點 2023-5-30
細菌編碼許多轉錄因子（transcription factor，TF），這些轉錄因子通過與啟動子周圍的DNA結合并調控RNA聚合酶（RNAP）全酶以結合啟動子DNA或異構化為主動轉錄構象的能力來調節轉錄起始。目前對T
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893 次 MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在結直腸癌PD-1免疫治療中的作用 2023-5-26
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領跑多組學科研服務的易基因。結直腸癌（colorectal cancer ，CRC）是全球最常見的癌癥之一，轉移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫檢查點阻斷（Immune che
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1013 次 mRNA-seq轉錄組測序應用于原位自組裝類器官用于軟骨組織再生 2023-5-24
期刊：Bioact Mater影響因子：14.593導語由于在誘導間充質干細胞(MSCs)向軟骨和骨室的空間、定向和可控分化方面存在困難，分級骨軟骨單位的再生具有挑戰性。新興的類器官技術為骨軟骨再生提供了
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